可在病变的龟头，包皮上取材镜检或培养可找到念珠菌，滴虫性龟头炎可在分泌物上找到滴虫。或是直接镜检这种龟头炎的检查是刮取阴茎龟头、冠状沟或包皮处皮损表面鳞屑作为待检标本。
滴虫性尿道炎是男性比较常见的，可以观察一下尿道有没有烧灼痛而尿道口处痒感，或者伴有尿频、尿急、尿痛的现象，也可以取新鲜的尿道分泌物做镜检可发现活动的毛滴虫，也可以做一下膀胱尿道镜检查。
滴虫性外阴炎需要取阴道分泌液用悬滴法检查，在镜下可找到活动的滴虫，在染色涂片中亦可见到。必要时可进行培养。滴虫感染时影响阴道细胞，应注意与恶性肿瘤鉴别，必要时可于治疗后作阴道细胞学检查。
应该检查阴道分泌物，白带的检查就是可以检查出来是否有阴道滴虫病，生理盐水悬滴法：这是最简便的一种检测方法，取分泌物与已滴在玻璃片上的少量温生理盐水调和、镜检，显微镜下可以见到呈波状运动的滴虫及增多的白细胞被推移。此方法的敏感性60%~70%。
无论是急性还是慢性滴虫性阴道炎，确诊都要借助实验室检查。病人在检查前不要做阴道冲洗或阴道上药，24～48小时内不宜有性生活。悬滴法是检查滴虫感染最常用的实验室检查法：在载玻片上滴一滴温生理盐水，在阴道后穹窿取少量分泌物混于盐水中，立刻在显微镜下观察，如果找到活动的滴虫，即可确诊。
滴虫性阴道炎通过常规妇科检查，初步筛选可能疾病，并取分泌物标本做必要的检查。主要检查外阴、阴道、宫颈、子宫、盆腔。白带常规，宫颈刮片。检查子宫、附件，了解子宫、附件有无肿瘤、囊肿等疾病。雌激素的检查，了解一下激，素水平！雌二醇，垂体催乳，促黄体生成素，促卵泡素，孕酮五项。