多囊肝、多囊肾，治疗上主要以对症治疗为主，比如多囊肝、多囊肾的患者，如果出现了血尿，患者早期卧床休息，合并感染积极的抗感染治疗。如果囊肿过于巨大，而产生了压迫的症状，比如多囊肾出现腰部的疼痛，肝囊肿出现上腹部的疼痛，这时如果有单个的囊肿比较巨大，可以行去顶减压术，来减轻患者的这种疼痛不适。出现了肝功能的异常或者肾功能衰竭，对症的使用保肝类的药物、保肾降糖类的药物对症治疗。
多囊卵巢期间女性要避免久坐和熬夜，保持良好的精神情绪，少吃刺激性食物，少吃甜食、高油脂食物，不要乱补富含雌激素的保健品或药品，多吃豆制品，多吃富含膳食纤维的食物，多吃富含维生素C、维生素E、叶酸的食物。
多囊卵巢综合征是需要治疗后才能怀孕的，多囊卵巢的发病基础主要是体内雄激素水平偏高，卵巢内同时发育了大量的卵泡但不能成熟排卵，临床上往往会出现闭经，月经几个月不来，做抗苗勒氏管激素检查可以发现数值升高，做阴道B超可以发现卵巢内有多个卵泡，做激素六项检查可以出现睾酮数值升高。可以在医生指导下使用达英-35之类的药物治疗，经过调理可以恢复正常的月经规律，也是有可能会自然受孕的。
卵巢呈现东南亚改变是属于内分泌病症现象，主要是由于体内激素水平分泌紊乱，在彩超下会看到双侧卵巢内有很多没有发育成熟的卵泡，每一个切面都会大于十个以上，所以很形象的称谓卵巢多囊。
这是多囊卵巢最常见也是危害最大的症状之一，其发病原因是，多囊卵巢病人内的激素发生了紊乱或是卵巢功能不全，这些因素就会直接影响到受精卵的着床，使女性不孕。去专业正规的医院进行检查和治疗。多囊卵巢病人的饮食宜清淡有营养，多吃一些维生素和微量元素丰富的水果和蔬菜。
多囊肾多囊肝可以穿刺抽液来治疗。多囊肾多囊肝属于常染色体显性遗传性疾病，治疗主要是针对并发症的治疗，以及预防囊肿的增大，首先是饮食方面，不吃巧克力，咖啡，浓茶等含有咖啡因的饮料。