一般来讲，生殖器上有小水泡，主要是由于生殖器疱疹病毒引起的，这种病毒会通过性接触传染，感染后会在阴茎、阴囊、冠状沟、外阴、腹股沟、肛门等处长出透明的小水泡，水泡内液体清澈，但伴有明显的瘙痒和刺痛，可以使用阿昔洛韦、更昔洛韦等药物进行抗病毒治疗，局部使用干扰素软膏进行抗病毒治疗，一般情况下10天左右就会好转。
阴囊湿疹是湿疹中比较常见的一种，局限于阴囊皮肤，有时会延及至肛门的周围，少数可延至阴茎。阴囊湿疹的主要症状有阴囊皮肤弥漫性发红、肿胀、有剧烈瘙痒，可同时出现许多针头至米粒大小的丘疹、水疱。
一般情况下，阴茎上起水泡可能是生殖器疱疹、包皮龟头炎、阴囊湿疹等原因引起的。
1、生殖器疱疹：生殖器疱疹是由疱疹病毒引起的一种性传播疾病，会出现阴茎上起水泡现象。
2、包皮龟头炎：包皮龟头炎是包皮内板与阴茎头的炎症，有龟头潮红、阴茎上起水泡的表现。
冠状沟上长水泡是通过男女双方性交传染的。由于一些男性患者的自身免疫功能低弱，这个时候一旦感冒或者是有什么外伤，这种时候就会给各种病菌带来机会，得病的几率也就会增大。
皮肤表面出现水泡的原因很多，主要包括以下几种：病毒感染引起的水泡，比如单纯疱疹、带状疱疹、生殖器疱疹、水痘等。自体免疫反应引起的水泡，比如天疱疮、类天疱疮等。过敏反应引起的水泡，比如汗疱疹、大疱性表皮松解型药疹、敌敌畏皮炎。昆虫叮咬引起的水泡，比如丘疹性荨麻疹。五、摩擦引起的水泡，比如劳动或长时间走路引起的水泡等。
包皮长水泡可能是生殖器疱疹导致的，建议患者积极进行治疗，具体分析如下：
生殖器疱疹会出现包皮上有水泡样的变化，主要是生殖器疱疹病毒感染，一般都是通过性接触传染的。因此要保持固定的性生活方式，同时也要注意保持良好的性关系。生殖器疱疹在感染后，会有一种灼热的感觉。需要注意局部清洁，使用碘伏进行消毒、外用阿昔洛韦软膏、口服更昔洛韦等抗病毒药物。可以服用转移因子口服液，提高免疫力，防止复发。
