不好治。目前很多物理疗法和药物都不能清除病变周围皮肤中的潜伏病毒。在整个治疗过程中是漫长和痛苦的，并且对生殖器部位的局部组织损伤大，治疗费用也很高，还特别易复发。
肛内尖锐湿疣可以通过药物和物理手段来治疗。
尖锐湿疣是由人乳头瘤病毒感染引起的，初起为细小淡红色丘疹，随着病情发展会逐渐增大增多，呈单个或群集分布，湿润柔软表面凹凸不平，多呈乳头样、鸡冠状或菜花样突起。对于肛内尖锐湿疣的治疗，还是以局部去除疣体为主。患者可以在医生指导下使用咪喹莫特乳膏、鬼臼毒素软膏等药物缓解症状。对于病程较久或疣体较大的患者，可以前往医院通常液氮冷冻术或激光手术以及外科手术切除等方式来治疗。
使用冷冻法治疗尖锐湿疣症状的时候，如果有疼痛的情况出现的情况下，也可以使用止疼药物来进行治疗。另外在治疗的时候要避免有性生活的情况出现，要注意把贴身的衣物做消毒处理，清淡饮食，避免吃辛辣刺激食物。
纯中药很难治好尖锐湿疣，中药外用或中药口服可以做为辅助疗法。因为尖锐湿疣是属于赘生物，激光或冷冻具有快速消退皮疹的作用，而中药外用或口服没有那么快的消退赘生物效果，因此不做为尖锐湿疣的首选疗法。
男性尖锐湿疣通常会长在冠状沟、包皮、龟头等部位。
尖锐湿疣是由人类乳头瘤病毒感染引起的一种皮肤粘膜的良性增生，主要是通过性接触传染引起的。男性尖锐湿疣主要发生在肛门和外生殖器部位，主要通过性接触直接传染。它的好发部位一般是外生殖器，主要见于冠状沟、包皮、龟头、包皮系带、尿道口、阴茎体、会阴等，同性恋患者可见于肛门、直肠等部位。