乙肝大三阳与小三阳之间存在差异，大三阳表明病毒复制较活跃，传染性相对较强。
小三阳一般提示病情处于慢性化，传染性较弱。当然，对乙肝患者来说，也以大三阳或小三阳为准，及乙肝DNA和其他有关数值，对疾病进行全面的分析和判断，及抗病毒治疗方案的指导。临床上主要使用的是拉米夫定联合利巴韦林进行抗病毒治疗。当前乙肝患者在接受了正规抗病毒治疗后，病情很平稳，而抗病毒治疗则需长期服药，现在口服药物治疗时间至少为4年，部分病人需终身服药。
乙肝小三阳和大三阳的区别通常在于指标、治疗方案等方面。
乙肝小三阳与乙肝大三阳是不一样的，乙肝小三阳是指乙肝表面抗原、乙肝e抗体、乙肝核心抗体三个指标呈阳性，而乙肝大三阳则是指乙肝表面抗原、乙肝e抗原、乙肝核心抗体为阳性。乙肝小三阳患者只要肝功能正常，一般不需要进行任何的治疗，只需定期复查即可。而乙肝大三阳患者通常需要进行系统干预，以免肝功能严重受损。
所谓的大小三阳指的是乙肝免疫指标中e抗原的阳性或者是e抗原的阴性，阳性者俗称为大三阳阴性者称是小三阳。其实它只是血清学在检测过程中出现的一些免疫指标的变化，并不能代表病情的轻重或者传染性的大小病情的轻重，主要看肝功能的各项指标以及肝脏影像学以及病理学的一些指标传染性的大小，主要看血液中乙肝病毒的载量。
大三阳与小三阳的区别：大三阳是指乙肝两对半中第一三五项阳性，小三阳是指第一四五项阳性，大三阳的病毒复制高，对肝脏损伤较大，小三阳第四项阳性，病毒复制不是很活跃，对肝脏损伤也不是很大。
乙肝大三阳是表面抗原，e抗原，核心抗体阳性，乙肝小三阳是表面抗原，e抗体，核心抗体阳性，一般是乙肝大三阳具有更强的传染性的。建议要定期检查肝功能，当肝功能异常的时候才采取药物治疗，主要是抗病毒和保肝治疗，同时以后要养成健康的饮食习惯，避免辛辣食物的刺激，少喝酒。
乙肝疾病主要是分类携带者，大三阳或者是小三阳这几个方面，其中携带者和小三阳病毒数量都不是很高，这类人群也不用过度治疗，只要定期复查，病毒数量没有升高的情况下都不用去弹性，只有乙肝大三阳它的病毒数量在复制，所以需要治疗，这是他们两者的区别，还有就是引起肝脏损害可能性高。