微波炉加热食物的同时会使食物的分子结构发生改变，产生人体不能识别的分子，其中有些具有毒性，还可能致癌。肉类、奶类、谷物、水果和蔬菜经微波炉加热后都可能产生引起癌症的化学物，因而平时应尽量少食用微波炉加热的食物。
使用微波炉不会致癌。微波炉加热是物理加热，原理是使食物分子剧烈运动摩擦产生的热来加热食物的，不会改变食物的性质，自然就不会致癌物产生。微波是一种电磁波，跟收音机、电报所用的电波、红外线以及可见光本质上是同样的东西。
微波是一种电磁波，它能穿过玻璃、纸张、塑料和类似材料；微波炉内的电磁管发出微波，在微波炉内来回反射，被食物吸收后，引起食物中的水分子振动，从而产生热量，加热食物。用微波炉加热并不会使食物产生致癌物质。因为微波属热能射线，将热能传送到食物身上，食物本质并不会因而受到任何影响。
只要正确使用微波炉，加热食物有毒就不会对人体产生危害。家用微波炉微波的频率是2450兆赫，这种微波不能透入人体伤害内部的器官和组织，只能使皮肤和体表组织发热而已，只要不是持续长时间地辐射，一般不会对健康构成危害。
现在没有确切报道微波炉致癌，微波炉泄露的电磁辐射值微乎其微，穿透力极低，不会危害健康更不会致癌。实验结果也表明，微波炉和炒锅烹调的蔬菜营养成分基本没区别。所以不用有心里负担，可以放心用微波炉热菜。
经常吃微波食品的人或动物，体内会发生严重的生理变化。以微波炉烹煮或加热食物，会破坏食物营养，使到食物的营养大大减少，因为电磁波辐射改变和破坏了食物的分子结构。
