骨髓炎治疗可采用：开窗引流术，X线检查显示骨质局部已有破坏及骨髓腔阴影增宽者，可在骨髓腔内积脓部位进行骨皮质钻孔或开窗，防止炎症扩散，以利分泌物引流。死骨取出术，对死骨较大、已具备手术时机者可将死骨取出，是治疗慢性骨炎最常见和最基本的手术方法。
骨髓炎通过以下方法治疗最好：
对于骨髓炎的治疗首先要清除病灶，做到既不损伤正常的组织，又要准确保护骨与组织的完整性，给患者带来最小的伤害而获得最大的利益。之后行反复的冲洗，伤口内部使用抗生素控制炎症，使敏感药物直接作用在病灶处，全面彻底清除细菌。再次将较近的正常组织或者是松质骨充填缺损处，通过加压、牵拉，使骨获得再生重建，并且最后可给予中药的调护，提高患者的全身免疫力和抵抗力以加快骨髓炎的恢复。
骨髓炎在治疗上关键在于早期诊断，早期控制感染，防止死骨形成，避免转为慢性骨髓炎。早期需要联合应用大剂量有效抗生素，通常在体温恢复正常后，仍继续使用两周左右。抗生素治疗2-3天，不能控制局部感染时，应手术治疗。局部制动固定，缓解疼痛。慢性化脓性骨髓炎以手术治疗为主，原则上是清除死骨，炎性肉芽组织和消灭死腔。
在治疗上关键在于早期诊断，早期控制感染，防止死骨形成，避免转为慢性骨髓炎。早期需要联合应用大剂量有效抗生素，通常在体温恢复正常后，仍继续使用两周左右。抗生素治疗2-3天，不能控制局部症状时，应即刻手术治疗。局部制动固定，缓解疼痛。慢性化脓性骨髓炎以手术治疗为主，原则上是清除死骨，炎性肉芽组织和消灭死腔。
脚趾头骨髓炎可以通过以下方法进行治疗：
如果是发生在脚趾的急性骨髓炎，选择敏感抗生素抗感染治疗1-2周后如果局部症状缓解，停止静脉用药改为口服3~4周。如果2周症状不缓解，需持续用药至少三周直到症状缓解。如果仍伴有局部症状，需切开引流，结合抗感染治疗。对于发生于脚趾的慢性骨髓炎，如果是第2-4指，可与患者沟通后行截趾术。因脚的拇趾有部分承重的作用，因此尽可能保趾，实在治疗无效的情况下，再考虑截掉患趾。