对腱鞘囊肿多数病例无需特殊处理，由于腱鞘囊肿并没有造成明显症状，所以主动注意休息即可。
切忌局部反复按摩推拿，否则可能会导致腱鞘囊肿渐渐变大，造成疼痛症状时，特不必封闭针治疗。可通过手指将其挤出或手术取出。若做打封闭针治疗，麻醉时有一点疼，麻醉后也没有疼的感觉。打封闭针时要做好消毒处理，避免因为穿刺引起感染，在打针后要注意休息，避免打针处过多的活动。在打针后观察1周的时间，如仍有疼痛感，可进行第二针的注射。
不抽出腱鞘囊肿内的积液，不能直接打上封闭针，因为这样并不能消掉，还可可能会影响病情恢复。
在注射封闭针前，一般需要穿刺排出内腔内的积液，然后在局部注入糖皮质激素，这样就会引起囊肿的包膜粘连，阻止其包膜内的液体流出，造成腱鞘囊肿的再次出现。不过，如果想要彻底治愈，建议在医生指导下进行外科手术治疗。
较小的囊肿不适症状暂时不用治疗，较大的囊肿需要尽早手术，平时注意不要刺激囊肿部位，以免引起感染。囊肿是局部组织出现囊样变化，是与炎症，先天性发育，外伤，自身体质等多因素有关系，囊肿可以长在身体各个部位。
通常对于囊肿的治疗来说，首先要彻底分清区分囊肿是属于良性还是恶性的。如果囊肿是良性的，没有必要担心了，可以通过口服一些中药进行保守治疗慢慢调养。但如果囊肿是恶性的话建议要尽早采用手术的治疗方式进行治疗，如果手术治疗方式效果不佳的话，还可以再生全身化疗的方式，这些方法就可以彻底治疗囊肿。如肾脏囊肿，若是4cm以上的肾脏囊肿，可以通过腹腔镜手术就可以治疗；4cm以下的肾脏囊肿，也可以通过B超定位下穿刺进行治疗。
肛门地方是没有什么囊肿的，要么是肛周的感染，要么是肛周的脓肿。可以去做个B超看看，如果局部已经液化，那么就是脓肿形成，需要切开引流，如果没有液化，那就继续消炎治疗。