桥本甲状腺炎的发病原因并不明确，可能与遗传、免疫、环境等因素有关，桥本甲状腺炎是一种慢性甲状腺自身免疫性炎症，起病缓慢，多见于女性，其最终结局为甲状腺功能减退，如果甲状腺功能暂时正常，甲状腺肿大并无明显肿大，一般半年左右定期复查甲状腺功能及甲状腺超声即可。如果桥本甲状腺炎合并甲状腺功能减退，需要长期使用甲状腺激素替代治疗，在服药期间需要监测甲状腺功能变化，根据甲状腺功能调整药物剂量，如果桥本甲状腺炎伴有明显的甲状腺肿大，同时压迫周围组织，可以考虑手术治疗。
甲状腺功能正常的桥本甲状腺炎患者适当限碘，日常饮食可食用加碘食盐，但需适当限制海带、紫菜、海苔等富碘食物的摄入。
由于个体的差异较大，如疾病发展程度、药物敏感性、依从性、身体素质等。需要医生根据患者的具体情况选择药物。临床甲减（TSH升高且甲状腺激素水平降低）患者，给予左甲状腺素替代治疗，以维持甲状腺功能正常。如果甲状腺肿大特别明显，压迫气管、食道造成呼吸困难、吞咽困难等症状，或者伴有甲状腺恶性病变时，需要进行手术治疗。
一般情况下，桥本甲状腺炎可采取使用药物、手术治疗等方法治疗桥本甲状腺炎，具体内容如下：
当桥本氏甲亢病人的甲状腺机能不正常时，必须进行手术。不过对于桥本甲状腺没有造成甲状腺机能不正常的情况，通常会采取药物疗法，而不会采取外科和放射疗法。桥本氏甲亢，主要是由于甲亢的破坏性抗体升高，造成了甲状腺的损伤，从而造成了甲状腺机能下降。但如果做了外科和辐射，就会对甲状腺的损伤，从而导致甲亢的病情恶化。
桥本甲状腺炎的患者可以酌情的用艾灸，但是艾灸并不能治疗，乔本甲状腺炎，只能起到辅助治疗的作用。
因为艾灸可能在一定程度上可以缓解患者的一个临床症状，改善患者的病情，然后在一定程度上，也可以提高患者的免疫力。但是艾灸它的循证医学依据不充分，临床疗效也不确切，所以可能应用在不同的个体身上，它的疗效并不确切。所以桥本甲状腺炎，使用艾灸好与不好，可能要具体看是使用在什么个体身上，或许有一些患者使用艾灸，它的临床疗效比较明显，而有一些患者使用艾灸治疗的话，它的临床疗效不明显。
孕妇患有亚急性甲状腺炎，这在临床上很常见，需要根据病情程度口服药物治疗。
因为孕妇的用药有限，而亚急性甲状腺炎是一种自限性疾病。症状轻的人可以吃更多的蔬菜和水果，以确保适当的营养。高热患者可在医生指导下使用退烧药。同时，也可以结合中医，选择中药汤剂和口服，或应用一些传统的中医理疗等。
其次，在桥本甲状腺炎的甲状腺功能亢进阶段，可以根据情况选择抗甲状腺功能亢进药物。如果病情不严重，可以观察并暂时不使用药物，但严重的情况下，可以口服丙基硫氧嘧啶。
桥本甲状腺炎的治疗方法如下：
1、饮食治疗：患者可以采用饮食治疗的方法，从根本上减少身体炎症，修复失衡的免疫系统。坚持这种饮食疗法一段时间后，甲状腺抗体会大幅降低。
2、呵护好肾上腺：大多数桥本患者同时患有肾上腺疲劳。也就是中医所说的肾阳虚，表现为畏寒、神疲乏力、精神不振、记忆力减退、腰膝疼痛、嗜睡、多梦、性欲减弱等。在治疗甲减的同时，需要护理好肾上腺。
3、适量运动，能慢跑、瑜伽、打太极。但是，请记住不要过度运动。因为那样会加剧肾上腺疲劳。
4、早睡早起，充足睡眠，不熬夜，不吃夜宵。