男性生殖器疱疹主要由单纯疱疹病毒感染引起。理论上，可以由当地人民医院或中医医院、皮肤科和泌尿科治疗。可以选择抗病毒药物、阿昔洛韦或伐昔洛韦乳膏或口服药物联合治疗。这两者需要一起使用，然后可以调整免疫力。
生殖器疱疹可以到正规三甲级别的医疗机构或者是专科医疗机构就诊，都很好，可以选择药物治疗，注意卫生，平时不要熬夜和劳累，以免引起身体的免疫力低下，影响疾病的治疗。
生殖器疱疹是一种传染非常强的性疾病，接触到病毒后3-5天，生殖器部位出现不适，起水泡。少数患者有高烧，头痛、全身不适，肌肉痛，水泡有单个或多个不等并溃疡，3-4天后开始干枯，结痂，此时没有规范治疗，病毒沿感觉神经再次进入神经，继续复制。如此时经过规范治疗，一般在一周左右治疗。
感染疱疹病毒会有复发的。内裤宜宽松，要穿棉质内裤，忌穿化纤织物不透气，容易使外阴潮湿、温暖，适于病毒繁殖生长，外阴病灶四起，难以清除。治疗期间不要有性生活的，没办法了，只能是去医院的。
建议及时到三甲医院就诊。在疱疹早期发病的时候，会有一些成群的小丘疹，还会时不时地伴有瘙痒或者是灼热的感觉。情况严重的就会出现溃烂，尽管这些症状在2-3周内会逐渐消退，可是还有复发的可能。生殖器疱疹及易感人群必须引起高度重视，对生殖器疱疹进行，遏制癌变。性行为当中安全套是无法做到百分百“安全”。所以在患病中要禁止同房，以避免交叉感染。
去医院正规治疗，一般性治疗，治疗还不能彻底清除病毒，也不能阻止疾病的复发治疗的目的主要是缓解症状，减轻疼痛，缩短病程及防止继发感染等。可以给于抗病毒药治疗：免疫刺激剂等肌肉注射。可以给于喷剂外用治疗。