男性生殖器疱疹主要由单纯疱疹病毒感染引起。理论上，可以由当地人民医院或中医医院、皮肤科和泌尿科治疗。可以选择抗病毒药物、阿昔洛韦或伐昔洛韦乳膏或口服药物联合治疗。这两者需要一起使用，然后可以调整免疫力。
1、洁身自好，避免不洁性接触、提倡使用避孕套。2、注意在公共场所的自我保护，尤其是女性，提倡淋浴、不直接坐在公共浴池、游泳池的坐椅、座式马桶等。3、讲究卫生，注意勤换洗内裤，不使用他人的盆具、泳衣、毛巾，上厕所前一定要洗手防止病毒沾染。4、内衣、床单以及其分泌物污染的用具可用煮沸或消毒液浸泡法消毒。在疱疹活动期，禁止性生活，以免被病毒传染。5、性伴侣一方患病时，另一方也及时前往医院检查治疗。
在治理的过程当中一般治疗的周期一周就差不多，有个别病人可能需要两周的时间才能愈合，这个病它有非常大的特点就是容易反复发作，很多病人在劳累以后或者喝了酒或者熬了夜以后疱疹就复发了，有很多病人一年复发要超过六次，这种病人他要长期用药，至少要用半年的抗病毒药物。
感染疱疹病毒会有复发的。内裤宜宽松，要穿棉质内裤，忌穿化纤织物不透气，容易使外阴潮湿、温暖，适于病毒繁殖生长，外阴病灶四起，难以清除。治疗期间不要有性生活的，没办法了，只能是去医院的。
生殖器疱疹治疗期间是可以吃酱油、鸡粉等食物的，只要不吃辛辣食物就可以。平时多运动，保持患处卫生，调节好饮食结构，多喝菜汤，预防便秘，不吃辛辣食物，少吃肉食和油炸食品，忌烟酒。