复发几率不大。巧克力囊肿术后人的对侧卵巢或同侧卵巢可能有新的病灶，医生又要开始重新用药，甚至有可能要面临再次手术。如果这种病人做过2-3次的手术以后，卵巢体积就会缩小，也就预示着卵巢功能会下降，将来有可能面临早绝经，或者卵巢的抗缪勒氏管激素会下降，卵巢的储备功能下降。
跟肥胖，压力大，休息不好，内分泌紊乱等方面有关，有性激素水平异常，排卵障碍，月经紊乱等症状表现。女性月经期一定要杜绝性生活。要注意自身保暖，避免感寒着凉。月经期间，禁止一切激烈体育运动及重体力劳动。随时调整自己的情绪，保持乐观开朗的心态，使机体免疫系统的功能正常。要去正规医院进行治疗，不要耽误治疗时期。
痛经为主要症状，为继发性且逐年加重，月经过多，月经血量多，也是临床常见症状之一，一般月经周期规律表现为经血过多或带经日久。性交痛：子宫直肠窝阴道后穹隆，宫骶韧带等部位的子宫内膜异位症均可发生性交痛，而且常于月经前较为明显。不孕。
卵巢的巧克力囊肿属于子宫内膜异位囊肿，其原因为子宫内膜异位到卵巢组织内。随着周期性的激素变化，异位的子宫内膜也发生周期性的变化。随着时间的延长，在卵巢局部形成卵巢囊肿。卵巢子宫内膜异位囊肿属于卵巢良性囊肿，虽然属于卵巢良性囊肿，但是具有恶性囊肿的性质。
饮食上可以随便吃。巧克力囊肿的治疗一般是选择手术，术后打针防止巧克力囊肿复发，所以巧克力囊肿跟饮食没有关系的，它的形成原因就是内膜移位了，导致巧克力囊肿发生，所以饮食上可以随便吃，不影响巧克力囊肿的。
生完孩子月经恢复后巧克力囊肿有复发可能，但也有个体差异。注意不要吃辛辣刺激生冷的食物，注意休息，调整好心情，注意保暖。同时要保持外阴的清洁和卫生，内裤要勤洗勤换，避免炎症定期复查。