使用干扰素抗病毒治疗，可以取得比较好的效果。甚至有一小部分可能会出现乙肝表面抗原的消失、乙肝表面抗体的产生，但此类人群比较少。对于慢性乙肝来说，干扰素的使用指征需要严格控制，一般需要优选人群，且在治疗过程中需要密切监测干扰素的不良反应。
乙肝的病毒携带者，如满足了干扰素的抗病毒治疗，应主动应用干扰素进行抗病毒治疗，但也有其不足之处，例如肝硬化失代偿期肝功能不好的患者，以及引起自身免疫有关的病症，例如甲状腺炎，自身免疫性的肝炎等。
干扰素的抗菌疗法有很大的优势，最大的优势就是可以停止使用。对于一些乙肝表面抗原呈阴性，但表面抗原含量偏低的患者，可以通过转阴来完成乙肝表面抗原的转阴，从而使乙肝病毒转阴，这个几率在30%以上，并且在转移后可以停止服用，周期比服用的护肝类的药物要快一些，大约需要一年的时间。
干扰素分普通干扰素和长效干扰素。普通干扰素大概每支50元-100元，一年大概9000元-20000元。进口干扰素大概1000元-2000元每支，乙肝在使用干扰素抗病毒期间，要处理好各种不良反应，包括必要时减量，对症处理或中止治疗等。
打干扰素治疗乙肝一般要一到两个月以后才可以看到病毒量降低。干扰素的作用相对较慢，不是直接的杀灭病毒，而是抑制乙肝病毒；所以需要有个过程。这种药物不是想用就能用的，一定要根据各项检查的结果，结合患者的年龄、性别、病史综合分析，选择恰当的治疗时机，才能达到疗效。
乙肝干扰素通常需要打一年左右，但具体注射时间需要根据具体病情来判断。
乙肝打干扰素的疗程通常要看具体的情况。在注射干扰素的过程中，如果病毒的浓度降低的比较好，表面抗原的含量降低的比较好，一般打一年左右即可。如果一年之后，表面抗原的含量还在不断的降低，那么可以通过延长疗程来促使乙肝表面抗原的转阴，可以延长至72周-96周。但如果使用干扰素不起作用，可以在3个月后停止使用，可以服用核苷类的药物。