阴茎的发育主要是靠激素水平和阴茎海绵体自身发育来维持的。可以到专业的泌尿外科和男科检查激素水平或阴茎海绵体血流多普勒，这样才能通过数据选择，药物干预和物理治疗，达到一个正常的发育状态。手术治疗要在医生的指导下才能应用。
阴茎短小，先去医院抽血化验性腺系列。如果正常，最常见病因就是手淫和包皮过长，尽快彻底戒掉手淫，手淫导致发育期发育不良或者停止，阴茎海绵体挫伤，阴茎越来越短小，增加营养，多吃高蛋白食物，牛羊肉，海参，另外包皮过长、肥胖也是阴茎短小病因，如果有包皮过长割掉包皮，肥胖必须减肥，对发育期阴茎发育有好处。
阴茎大小和个人体质遗传有关系，正常成人的阴茎在疲软状态下有7-9厘米，勃起以后大概就是11-16厘米。如果疲软状态下小于5厘米，而且勃起时小于10厘米，才能叫阴茎短小。作为大多数男性来讲，性成熟期是18周岁，基本发育就差不多了。
成年以后已经很难再进行发育，一般只要勃起后超过九厘米，就算是正常的情况，另外性生活的过程中不短于两分钟也算正常。口服药物，如果药物治疗没有作用也可以选择手术治疗，但手术治疗的风险比较大。多食一些具有补肾固精作用的食物，如牡蛎，胡桃肉，栗子，甲鱼，文蛤，鸽蛋，猪腰等。
在临床上评定男性是否属于阴茎短小，是需要看在勃起的时候阴茎长度是否低于八公分，如果低于八公分就属于阴茎短小，目前来说能达到延长阴茎的最直接有效的办法就是通过延长手术，手术的原理就是将隐匿在体内的那部分阴茎延长出体外。
肥胖的人因为阴部脂肪较多，从而覆盖并阻塞了阴茎，使阴茎显得很短，实际上阴茎并不真的很短。也不需要阴茎延长手术等治疗。主要原因是肥胖。应该加强体育锻炼来消耗体内多余的脂肪。同时，人们应该节食，多吃蔬菜和水果，不要吃太油腻的食物。只要减肥成功，阴茎就不会变短。