支原体、衣原体等是轻度或中度的，自身的免疫功能是可以自行恢复的。支原体、衣原体感染、自身免疫力低下等情况，是很难治愈的。
对于支原体、衣原体的治疗，可以选择红霉素、阿奇霉素、罗红霉素等三种药物。近年来，对支原体的抗药性越来越强。抗药性高达75%，使用红霉素类的药物也不一定有效。如果治疗无效，可以选择环丙沙星、左氧氟沙星等喹诺酮类药物。另外，四环素、多西环素、米诺环素等都是四环素。
支原体衣原体感染会影响怀孕：
泌尿生殖道感染支原体后，引起的疾病男性为非淋菌性尿道炎，表现为尿道刺痒、烧灼感和排尿困难，少数有尿频。尿道口轻度红肿，分泌物稀薄，部分病人无症状。女性主要为非淋菌泌尿生殖道炎，表现为白带增多，尿道灼热或引起盆腔炎，输卵管炎等而引起不孕，流产和宫外孕.所以如果发现有此问题，最好是在医生的指导下进行有效的治疗。
支原体感染和衣原体感染是可以治愈的。
目前支原体感染和衣原体感染对许多抗菌素敏感，采用针对性的抗菌素治疗一般都能治好。由于支原体没有细胞壁，因此对青霉素、头孢素、磺胺类等会产生一定的抗药性，对四环素、红霉素、阿奇霉素等药物比较敏感。阿奇霉素对衣原体和支原体均有良好的疗效，可以成为临床上的首选药物。
支原体、衣原体导致的咳嗽一般不能自愈。
原体、衣原体属于一种病原体，属于一种介于细菌和病毒的病原体。其主要侵害的部位有气管粘膜、生殖器、皮肤、粘膜等，当机体免疫力降低后，就会出现临床表现，出现咳嗽，需要及时就医治疗，不能自愈，得到正规的处理后，就可以痊愈。
患者应该及时配合医生的治疗，以免治疗不及时耽误病情。
如果是在正常的夫妻关系中，也会受到衣原体支原体的影响。衣原体可以由下列方式传染。
可以通过直接传播、性传播，衣物、被褥、毛巾、浴缸、卫生间等直接接触传染。
还可能会由孕妇和孕妇的产道传染给婴儿。在胎膜完好的情况下，衣原体支原体的传染不一定通过性接触，但是通过性接触是最常见的。
检查男子支原体和衣原体的方式如下：
1、采集尿路的排泄物，对于有大量尿路分泌的病人，进行排泄，然后通过无菌试管采集尿路中的分泌物进行检测。
2、可以通过尿样本进行支原体、衣原体核聚变的检测，确诊有无感染。一般保留样本是最好的选择，因为可以用PCR检测出更高的精确度。