按病变程度分类：单纯性肛瘘，只有一条瘘管，内外口直通的肛瘘；复杂性肛瘘，瘘管和外口在两条或两个以上，但内口可以是一个或多个的肛瘘。按病变的深浅分类：低位肛瘘，瘘管管道位于外括约肌深层以下的肛瘘；高位肛瘘，瘘管管道位于外括约肌深层或耻骨直肠肌以上，内口在齿线或齿线以上的肛瘘。
肛瘘的症状是会排脓，脓汁粘稠，黄色、味臭；瘘管日久的排脓相对较少，或时有时无，稀淡如水；若脓量增加，则表示新瘘管生成瘘管有时会暂时封闭，不排脓液，从而出现局部肿痛，体温上升。
肛瘘的常见症状主要是间断性肛周肿痛及破溃流脓。间断性肛周肿痛，是由于肛瘘外口引流不畅或者暂时封闭以后，瘘道内存在感染，导致局部肿痛。当肿痛到达一定程度后，就会出现外口破裂，继而使脓液引流，病人的症状逐渐减轻。由于没有解决肛瘘的内口和窦道，会经常出现局部肿痛及破溃流脓。由于经常发作，有时候会出现外口引流不畅，这时局部感染以后可能向周围蔓延，会形成多条瘘管。
肛瘘手术治疗的方式有肛瘘切开引流术、置管或挂线引流术、肛瘘切开术、瘘管剔除术、主灶切开支管旷置术以及挂线术、双向等压引流术、瘘管填塞术，还有国外的VSD负压封闭引流术。可以根据病情的发展选择合适的治疗方式。
症状可能是痔疮引起的，与便秘有关，痔疮分为内痔和外痔，平时多吃蔬菜水果，预防便秘，可到医院肛肠科确诊一下。饮食不节：如食用辛辣刺激食物、过量饮酒或食用海鲜导致腹泻，长期反复的腹泻引起局部感染，蔓延至肛门周围，形成肛瘘；2、病人有基础疾病：包括血液疾病，其免疫力和全身抵抗力下降；传染性疾病如结核，感染结核杆菌后，引起肛周病变；传染性的性传播疾病。