治疗肛周脓肿治疗，一般是需要及时切开引流，排出脓液，并且定期进行换药处理，以观察伤口创面的愈合情况，后期可以在每次大便之后，使用消炎溶液坐浴，另外，肛周脓肿的病人需要酌情进行抗菌素治疗，可以根据病情给予口服、肌肉注射或者静脉滴注。
肛周脓肿只能手术治疗，如果不及时治疗，有可能演变成肛瘘。肛周脓肿一旦治好，不再形成肛瘘。尽早手术的原因是肛门周围组织较疏松，且间隙多，故当一个间隙发生感染后常会迅速波及到其他间隙，引起多个间隙的混合感染，所以肛周脓肿应及早手术治疗。
轻微肛周脓肿可以理疗、外敷中药或用抗生素作局部注射等，但多数需要手术治疗，还可以采用温水坐浴进行治疗，平时保持肛门清洁，注意卧床休息，多喝水保持大便通畅，注意饮食，多吃润肠通便的食物。
治疗肛周脓肿的方法有手术，且越早越好。肛周及会阴部可见片状黑色病变，皮下可触及捻发音，严重的大片皮肤及筋膜进行性坏死，波及阴囊、大阴唇，有的到达直肠下段、下腹部、后腰部，面积广，蔓延速度快。
如果进行性增大，形成痈，则应该就医进行局部切开引流，避免反复或加重，同时避免不良的接触和刺激，防止烟酒熬夜劳累受凉，调整好心态，避免压力过大，逐渐地改善减轻。