输精管堵塞，首先可能会造成男性的不育，因为精子不能通过输精管排出。另外，会造成睾丸的萎缩，还有就是会引起并发症，比如睾丸缩小等。另外，还会对病人的心理造成很大的阴影。
目前对于输精管阻塞的治疗主要是对因治疗的，也就是说先要找出输精管阻塞的病因，找出病因后先治疗病因，病因治好了以后输精管自然就会通畅了。临床上对于输精管堵塞的治疗最为常见的方法还是手术治疗，其中，输精管吻合术就是一种能有效治疗输精管堵塞且难度较低手术，具有对输精管堵塞的损伤小、治疗时间不长等的优点。
输精管堵塞会导致精子无法排出或者只有少量精子排出，即导致少精症或无精症，造成男性生育困难。有的会表现出尿频尿痛等症状，所以不治疗，会造成泌尿系统感染以及生育困难。
输精管堵塞治疗时首先应针对原发病治疗，如抗炎、抗痨、抗肿瘤等，亦可将堵塞处切除后进行断端吻合，个别情况下可直接从附睾处吸取精子进行人工受精。针对梗阻的原因和部位，恢复输精管道的通畅。输精管道阻塞的常见治疗有输精管吻合术。
可以进行精液常规检查，输精管堵塞患者精液中精子数量明显减少，甚至严重的时候还会出现的症状就是无精症，输精管造影可以直接检查输精管、精囊、射精管等器官的形态、位置。
预防输精管堵塞有以下方法：男性需常用食指和拇指轻轻压挤检查附睾头，注意是否有由于输精管堵塞造成的附睾硬结和瘀积现象。如发现这样的体征，速到医院就诊，做输精管造影，了解输精管堵塞的通畅情况。