输精管堵塞治疗时首先应针对原发病治疗，如抗炎、抗痨、抗肿瘤等，亦可将堵塞处切除后进行断端吻合，个别情况下可直接从附睾处吸取精子进行人工受精。针对梗阻的原因和部位，恢复输精管道的通畅。输精管道阻塞的常见治疗有输精管吻合术。
输精管堵塞，首先可能会造成男性的不育，因为精子不能通过输精管排出。另外，会造成睾丸的萎缩，还有就是会引起并发症，比如睾丸缩小等。另外，还会对病人的心理造成很大的阴影。
输精管堵塞会导致精子无法排出或者只有少量精子排出，即导致少精症或无精症，造成男性生育困难。有的会表现出尿频尿痛等症状，所以不治疗，会造成泌尿系统感染以及生育困难。
目前对于输精管阻塞的治疗主要是对因治疗的，也就是说先要找出输精管阻塞的病因，找出病因后先治疗病因，病因治好了以后输精管自然就会通畅了。临床上对于输精管堵塞的治疗最为常见的方法还是手术治疗，其中，输精管吻合术就是一种能有效治疗输精管堵塞且难度较低手术，具有对输精管堵塞的损伤小、治疗时间不长等的优点。
要根据病的程度来判断治疗的时间。输精管堵塞不是一个独立的病，而是多种病造成的一种症状。进行正确的治疗，坚持治疗，减少吃那些辛辣，刺激的食物。多吃一些清淡的。
输精管堵塞不是一个独立的疾病，而是多种疾病造成的一种症状。治疗时首先应针对原发病治疗，抗炎、抗痨、抗肿瘤等，亦可将堵塞处切除后进行断端吻合，也可以采用中医疗法，用中药来调节。