亚临床甲减的治疗需要自身的一些症状，还有TSH升高的程度来进行判断。如果TSH升高的不明显，也没有明显的症状，就可以考虑随诊观察。如果具有一些甲减的症状，也可以给予小剂量的甲状腺激素进行治疗。如果TSH明显的升高，化验血清中过氧化物酶抗体也明显的升高，就应该进行甲状腺激素的替代治疗。
可以药物治疗，甲减是甲状腺激素合成分泌减少引发的病症，出现皮肤干燥增厚，腺体分泌减少，发质干枯，心率减慢，食欲减退，疲倦无力，粘液性水肿等症，小儿可引发呆小病，病因常见于甲状腺本身病变，垂体下丘脑病变等。
中医常根据甲减患者的症状进行辨证治疗，如辨证为脾肾阳虚，常用六味地黄丸或四君子汤，如为气血不足，可辅以补气养血的药物，如黄芪、党参。如为阳气不足可辅以补肾阳的药物，如仙灵脾。
甲减是一种全身代谢减低综合征，除了少数甲状腺炎引起的一过性甲减可以治愈之外，其他的都是无法治愈的，需要终生服用药物进行治疗，如果不及时治疗，可能会出现疲劳、体重增加、记忆力减退、反应迟钝等症状。
青春期产生的加减，可能会导致青少年的发育受到影响，而成人产生的加减，则可能会影响导致患者的生育力和性欲，女性患者可能会出现月经不调、流产的可能。
甲减就是甲状腺机能减退症,它属于内分泌科的一种常见病以及多发病,属于自身免疫性的疾病。甲减主要是由于甲状腺手术、治疗、自身免疫性甲状腺炎等原因引起的。这些原因导致甲减需要外源性的补充甲状腺激素来替代治疗，目前还没有任何的技术和药物，所以治疗甲减主要是为了保持甲状腺功能正常，大多数甲减患者通过治疗甲功恢复正常就能正常工作。