乙肝病毒很难被清除，治愈也很难。慢性乙型肝炎无论是大三阳还是小三阳，治疗的目标是最大限度的控制乙肝病毒复制，减少或降低肝细胞炎症坏死，延缓疾病进展，防止肝脏的纤维化，肝炎肝硬化，肝癌及其它并发症的发生。如果乙肝小三阳达到抗病毒治疗标准时，需要及时抗乙肝病毒治疗。
以目前的医疗水平和治疗水平，乙肝病毒感染、小三阳、慢性乙型肝炎是没有办法彻底根治的。
有些病人可以通过提高自身抵抗力来清除体内的乙肝病毒，也有一些患者通过积极的综合抗病毒治疗，有机会彻底清除体内的乙肝病毒。但相对来说，这种可能性更小，也更难复制。所以，如果确诊为慢性乙型肝炎，不管是小三阳还是小二阳，都要注意养成良好的生活习惯，定期复查一次。如果达到抗病毒治疗的标准，应该积极的进行抗病毒治疗，同时要注意用药，需要长期用药，不能随意停药。
乙肝小三阳的病人是否可以受孕，需要根据病人的肝脏情况来确定。
肝脏功能一般就可以妊娠，但是孕期要注意肝功能，每月做一次肝脏的检查。如果出现肝脏的问题，一定要进行护肝的检查。需要进行抗菌药物的治疗，一旦达到了一定的程度，就要进行药物的抗菌处理。另外，要密切关注病毒载量，尤其是病毒载量在10倍以上的6次方时，要使用核苷类的药物进行抗菌，并进行母婴阻断。分娩后要及时给宝宝接种乙型肝炎和免疫球蛋白，以防止感染。
通常情况下，怀孕的小三阳孕妇是不能哺乳的。具体内容如下：
血液传播、性传播、母婴传播是乙肝病毒传播的一种途径。乳汁中有乙肝病毒，宝宝吃了含乙肝病毒的奶水，有很大的几率会被乙肝病毒感染，所以如果是小三阳的妈妈，千万不要给宝宝喂奶，避免宝宝感染。同时要注意母婴阻断，孕妇要服用抗病毒药物，新生儿出生后要及时接种乙肝疫苗。
说明乙肝已趋向恢复，属于慢性携带者，传染性弱，长时间持续此种态可转变为肝癌。因此还需要了解肝功能、HBV-DNA定量、肝脏B超的结果，如果这些项目结果正常则不需要治疗，要定期复查。
小三阳在肝功能正常的情况下，一般不需要治疗。但是在乙肝病毒DNA高于2000，谷丙转氨酶超过正常值上限，或者转氨酶虽然正常，但有肝硬化的情况下。对于年龄超过30岁，病毒量很高，虽然没有肝硬化，但家族中有肝硬化和肝癌的，也可以考虑治疗。