应及时进行抗病毒治疗，常见的抗病毒药物可抑制乙肝病毒复制，但停药就复发，需长期使用。长期使用可因产生耐药而失效，故又不宜应用过长，使用半年后应联合用药以避免失效。
乙型肝炎的治疗是综合性的治疗。要诊断是急性肝炎还是慢性乙型肝炎。急性乙型肝炎对于成年人可以治疗好，不会转为慢性的，慢性乙型肝炎大部分人是终生性的疾病，需要终生定期复查和治疗。
乙型肝炎，是否需要治疗和如何治疗需要具体的临床症状和表现，乙型肝炎的临床表现可以多种多样。如果病人的免疫功能和病毒的致病力相差无己，病人既不能把病毒清除体外，病毒也不会对身体导致大的伤害，可以表现为病毒携带状态，不需要治疗。如果做检查属于大三阳或者小三阳，病毒复制活跃，需要在指导下给予积极抗病毒治疗。
妊娠期乙肝一般不需要特殊治疗。
孕妇如果没有肝功能异常，需要定期监测肝功能和肝脏彩超。如果出现合并肝炎，可以通过药物保肝，监测胎儿的宫内情况，必要时及时终止妊娠。妊娠期乙肝孕妇在娩出胎儿后要注射乙肝疫苗和乙肝免疫球蛋白，通过以上阻断，产妇病毒定量不高时，就能正常母乳喂养。
孕期出现不适，建议及时前往医院就诊。
乙型肝炎目前没有彻底根治的治疗药物上市，但是通过研究调查发现在一些特殊选择的人群中，比如在表面抗原水平非常低，乙肝病毒DNA水平非常低的情况下，而且有一次明显的炎症发作，转氨酶水平大于200以上，这些人经过长期的干扰素治疗，会有30％左右的人会出现表面抗原转阴，甚至出现表面抗体，称为功能性治愈。