乙肝病毒很难被清除，治愈也很难。慢性乙型肝炎无论是大三阳还是小三阳，治疗的目标是最大限度的控制乙肝病毒复制，减少或降低肝细胞炎症坏死，延缓疾病进展，防止肝脏的纤维化，肝炎肝硬化，肝癌及其它并发症的发生。如果乙肝小三阳达到抗病毒治疗标准时，需要及时抗乙肝病毒治疗。
如果检查乙肝两对半确诊是乙肝小三阳，没有肝功能损伤及病毒复制，没有症状者不需要特殊用药的，定期复查即可。平时尽量注意作息及饮食。少吃辛辣刺激性食物，多吃新鲜水果蔬菜。
小三阳在肝功能正常的情况下，一般不需要治疗。但是在乙肝病毒DNA高于2000，谷丙转氨酶超过正常值上限，或者转氨酶虽然正常，但有肝硬化的情况下。对于年龄超过30岁，病毒量很高，虽然没有肝硬化，但家族中有肝硬化和肝癌的，也可以考虑治疗。
有感染胎儿的可能，如果是乙肝小三阳活动期，需要将乙肝病毒DNA控制在正常范围内半年以上再考虑怀孕，另外怀孕期间需要按时注射乙肝免疫球蛋白进行阻断干预治疗，可以有效的降低感染胎儿的概率。
乙肝小三阳是否需要治疗，患者需根据具体的情况来判断。
对于乙肝小三阳，只要肝脏和dna都没有问题，患者通常为健康携带者，只要按时随访，不用吃药，如果是HBV、DNA、肝脏等指标都比较高，就要进行相应的检查。肝功能转氨酶超过2倍，同时乙肝DNA超过10，则要进行抗菌和护肝治疗，同时还要定期进行肝功能检查和DNA检测。