病毒复制指标持续阳性者，抗病毒治疗是一项重要措施。有些药物作用较慢，需较长时间才能看到效果。由于抗病毒药物的疗效有限，且仅当病毒复制活跃时才能显效，故近年治疗慢性乙型肝炎倾向于联合用药，以提高疗效。
乙肝一般是指慢性乙型肝炎，是一种由乙型肝炎病毒感染所致的疾病。在治疗上主要通过抗病毒的治疗，同时给予护肝降酶治疗。
护肝降酶的治疗上，患者可在医生指导下服用葵花护肝片这类中成药，该药物能够帮助调节肝细胞生长和分化，稳定并修复稳定和修复细胞膜机制，有效降低人体转氨酶，可减轻乙肝症状。同时还需遵医嘱联合抗病毒的药物，来延缓病情发展，例如恩替卡韦、替比夫定等抗病毒药物。联合用药可调节肝损伤，降低受损风险。
由于各种抗病毒药物很难有所作为不宜一味追求阳转阴，提高个人免疫功能和抗病毒能力，力求消除乙肝病毒和保持不再发病，不吃刺激性重的食物，确保睡眠注意休，多吃含B族维生素的食物，保护肝脏。
乙型病毒性肝炎是有可能通过母婴途径从母体直接传染给孩子的。需要结合乙肝五项定性和定量，肝胆B超，肝功能和医生检查来确诊。建议采取中西医结合治疗，在医生指导下口服抗病毒药物，配合中医辨证治疗，孩子出生时立即注射高效价一乙肝免疫球蛋白，同时进行乙肝疫苗接种。一般都可以有效的阻断母婴传染。
保肝治疗，但是药物不要过多，过多的药物：中药或西药都可能反而会造成肝脏损害。因为任何药物都要通过肝脏代谢。都会或多或少加重肝脏损害。肝功能正常就不需要特别治疗，肝功正常才是目的。感染乙肝病毒后，也可能会凭借自身存在的免疫功能，清除病毒，最终战胜病毒，体内形成表面抗体。
对于肝硬化病人，要针对肝硬化的情况和相应的合并症采取相应的处理措施。
在肝硬化代偿期患者需要进行正规的药物治疗，同时要进行常规的药物检查，以控制病情的发展。在肝硬化失代偿期患者，需要针对其发生的各种合并症进行相应的处理，比如腹水患者要利尿禁食，控制食盐，需要时注入清蛋白，如果是上消化道出血性大肠杆菌，则要降低门静脉压力，防止流血，保护胃部，需要做外科手术。其它的并发症包括肝脏、肾脏疾病、炎症、电解质失调等。