输尿管结石依据结石大小、部位及有无合并症治疗方式不一，结石＜0.6cm，没有合并症，可通过多喝水、多运动等排石治疗将结石排出，或是服用排石药物。结石较大，合并梗阻、感染，可行微创手术。微创手术损伤较小，出血较少，优于开放式手术。
可口服止痛药进行止痛，结石大，可以采用体外冲击波碎石，或留置输尿管支架解除梗阻，达到止痛效果。输尿管结石因导致尿液排出受阻，肾盂内压力突发增高，导致肾绞痛的发生。
治疗输尿管结石需要结合结石的大小来采取相对应的治疗方法，如果输尿管结石小于1cm，并且没有明显的尿路感染，可以大量饮水，服用中药，使结石排出。但如果结石较大，可以使用输尿管镜下取石和碎石，以及体外冲击波碎石，去正规的医院做一下详细的检查，遵循医嘱，采用适合的方法治疗。
输尿管结石是泌尿外科常见病、多发病，根据结石的部位可以分为输尿管上段、中段和下段结石。输尿管下段结石的治疗，如果结石小于0.5cm，可以采用保守治疗，通过多喝水、多活动、多排尿口服排石的药物进行治疗。如果结石大小在0.5-1cm，可以采用体外冲击波碎石，也就是体外碎石，需要注意如果是未婚女性不要采用这种办法。
包括保守治疗和微创手术治疗，输尿管结石是最常见的上尿路结石，多发生于中壮年，男性多发，在泌尿系结石中，大约20%位于输尿管，其中70%位于输尿管下段，其典型症状主要是腹部绞痛和血尿。
输尿管结石运动治疗是输尿管结石保守治疗排石的一个非常重要的一个环节。可以单脚跳，这样跳跃的时候，随着身体的上下的震动，结石在体内的和输尿管会产生向下的位移，这样结石就可能往下，不断的通过重力因素，不断的往下走，便于结石的排出。