半相合骨髓移植后的排异反应大，主要表现为皮肤红斑和斑丘疹，持续性厌食和腹泻，肝功能异常等。急性移植物抗宿主病的预防更为重要。慢性移植物抗宿主病主要表现为类似于自身免疫病的表现。
半相合骨髓移植的成功率，具有明显的个体差异性。因为在不同的骨髓移植中心，不同的病人个体，半相合骨髓移植成功率有着明显的区别。目前官方报道，半相合骨髓移植成功率达到了90%左右的水平，实际上真正骨髓移植成功的一般在50%左右。因为部分患者当时骨髓移植成功，但是有1/3的病人又出现了复发的情况。
半相合骨髓移植成功率即是骨髓匹配程度在50%，成功率在50%左右，目前已有不少半相合骨髓移植成功的例子，但风险也不小。半相合骨髓移植骨髓多来自亲属，来源稳定，如复发也可以回输，且排异症状较轻。
全相合配型骨髓移植成功率最少有四分之一，甚至二分之一。如果半年内经过基因检查，在病人体内发现供髓者的基因表达，且骨髓、血象及重要脏器检查指标正常，没有出现明显异常，那么就算骨髓移植百分百成功。
半相合骨髓移植的成功率，具有明显的个体差异性。因为在不同的骨髓移植中心，不同的病人个体，半相合骨髓移植成功率有着明显的区别。半相合骨髓移植成功率达到了90%左右的水平，实际上真正骨髓移植成功的一般在50%左右。因为部分当时骨髓移植成功，但是有1/3的病人又出现了复发的情况。所以半相合骨髓移植成功率，取决于不同的移植团队和不同的具体的病人的病情。
主要是同胞间的供者，因为一个家庭中同胞多，但是也只有30－40%的概率。在我国大量使用脐带血移植，但是脐带血移植成功率不高。方向主要是一个位点以内不相合的母亲供髓，截至目前共做了10例，成功了6例，而且成功率越来越高，预计会提高到80%。在供者问题上，首选同胞供髓，因为这种最成熟。
