大部分的输尿管结石在输尿管碎石之后很快疼痛就可以缓解了，一般需要3天。有些结石不光滑，或者是比较大，在往下排的时候，可以会对尿道有刺激，或者排到下一个狭窄的时候会重新引起梗阻，疼痛一周左右就会缓解。
肾结石碎石没有明显的疼痛。体外冲击波碎石的原理是利用机器产生的冲击波能量通过传导到结石上，引起结石粉碎，但是可以感受到明显的震感。碎石后小的结石碎块，在经过输尿管排出的过程中，却可以出现剧烈的疼痛。
肾结石外体碎石有一定的疼痛感。
通常情况下，肾结石患者在进行体外碎石术时，会感觉到不舒服，多数患者在碎石后会有痛苦，因为碎石过后，较细小的结石会顺着输尿管排泄，在排泄时会发生阻塞，使患者产生输尿管的抽搐，造成肾盂内部的压力升高，会使患者产生强烈的腰痛。这种痛苦主要是指绞痛，疼痛非常的强烈，需要立即去医院进行治疗，通过口服一些有效的镇痛药来减轻患者的痛苦，这样可以减轻患者的痛苦，直到将体内的毒素全部清除，这样的痛苦就会得到完全的减轻。
一般情况下，肾结石激光碎石可能会出现轻微的疼，具体内容如下：
如果患者肾脏内有结石，可以使用激光碎石来进行治疗，以排除怀着体内比较大的结石。而这种方式可能会导致患者感觉有类似于皮肤的针刺一样的疼痛，这种疼痛是可以忍受甚至可以忽视的。但是，激光碎石的作用就是打碎石头，使结石要通过输尿管排出来，所以，在排石期间患者可能会有腰部的剧痛，此时，患者可以遵医嘱服用布洛芬分散片、双氯芬酸钠片等药物来进行解痉镇痛。
可到医院进行输液治疗，主要使用扩张输尿管的药物，这样能促进结石排出，只有当结石全部排出就不会疼痛了。另外如果疼痛实在难忍，可肌肉注射止痛药，这样很快就会缓解疼痛的。