一般情况下，小孩衣原体肺炎主要是用大环内酯类药物进行治疗。
如果咳嗽咳痰并且伴有发烧症状，建议还是静脉输液治疗，主要是用大环内酯类药物进行治疗，常用药物有阿奇霉素、克拉霉素等。同时，患儿同时可有发热等伴随症状，需给予对乙酰氨基酚、布洛芬等药物进行对症处理，多吃一些新鲜的瓜果和蔬菜，避免烟雾和寒凉刺激。
一般情况下，怀孕后支原体、衣原体感染可以在医生的指导下服用大环内酯类药物治疗，比如：阿奇霉素。
支原体、衣原体感染可以经胎盘垂直传播或逆行性感染，引起宫内感染，可导致流产、早产、胎儿宫内发育迟缓等，小孩出生时可能会导致感染，出现结膜炎等。对于孕期的特殊感染，除了支原体、衣原体，还有弓形体、巨细胞病毒、风疹病毒等。这些特殊感染可能会造成胎儿畸形，要及时筛查，及时处理。
衣原体感染可给予抗生素治疗。
衣原体繁殖周期长，应用抗生素时间也较长。患者出现衣原体感染时，可在医生指导下使用药物进行治疗，临床上多以氧氟沙星片、罗红霉素片等药物较为常检查，若是不能耐受时可用阿奇霉素片进行治疗。
治疗期间应注意性伴侣也需同时治疗，注意保持患处健康。
女性衣原体阳性是比较好治疗的。
衣原体属于革兰阴性病原体，患者不用担心，可以遵医嘱使用药物进行治疗，经治疗后能够得到有效的处理。患者可以通过服用四环素、强力霉素等进行治疗，如果有抗药性或疗效不佳，可以在医生的指导下服用洛美沙星、环丙沙星等药物。
沙眼衣原体阳性可以通过药物治疗来改善。
沙眼衣原体阳性是一种性传播疾病，此类患者大多有高危险的性行为，主要有阴道分泌物增多、宫颈充血水肿、尿频、尿急等症状。严重的还会出现在宫颈管里面，会对身体造成一定的负面作用。在沙眼衣原体的影响下，首先要进行支原体敏感的药物的检查，同时还要应用红霉素、左氧氟沙星、四环素类等敏感的抗生素。
妇科衣原体感染可以根治，不用过于担心。
妇科衣原体感染后，可以在医生指导下使用氧氟沙星、多西环素、阿莫西林、罗红霉素等药物进行治疗，经过积极的进行治疗后，一般预后好，能够根治疾病。
在进行药物治疗时，不能有性行为，以免发生交叉感染。适当地休息，防止过度疲劳。
