肝内胆管结石不会自愈。如果患者有手术指征及早进行手术治疗。采取的手术方式是高位胆管切开取石术。如果患者肝内胆管结石造成某一叶的肝脏萎缩，可以行肝部分切除或者肝段切除。
肝内胆管结石能活20年-30年。肝内胆管结石不影响寿命，它是一种良性的病变，并不是癌症，也不是恶性的肿瘤。要保持良好的心态，生活要有规律，作息的规律，避免劳累以及精神的高度紧张。可以采用积极的治疗来去除肝内胆管的结石。
肝内胆管结石是临床消化外科常见的一种疾病，能够堵塞胆管，引起炎症感染，出现上腹部疼痛，腹胀，恶心呕吐，发热等症状，就能够治好，是比较好治的。建议B超检查确诊大小，进行有效医治。患者这样准确去家里附近的一家医院进行药物的医治，如果不良就需要去家里附近的一家医院进行一下手术医治的准确处理的呀。
通常情况下，引起肝内胆管结石的常见原因有胆汁的排泌障碍、细菌感染、寄生虫感染、先天的胆管扩张症等。
胆管结石是临床胆石症的一种，临床上最常见的症状是上腹部疼痛，可呈胀痛或是绞痛，部分患者伴有发热。肝管梗阻时，可出的黄疸，通常来说，引起肝内胆管结石的常见原因有胆汁的排泌障碍、细菌感染、寄生虫感染、先天的胆管扩张症等。
肝内胆管结石和肝囊肿同时发生需要到正规医院接受治疗。如果肝内胆管结石呈淤泥状分布且直径相对较小，有时会随着胆汁代谢排出体外因此可以不用手术治疗。然而，如果结石的直径相对较大，并伴有明显的腹痛，需要手术治疗。因为直径较大时恶性转化的风险会相应增加。
可以通过药物刺激，分泌出的胆汁使胆囊口自动打开，胆管自动放大，胆囊收缩时，通过药物刺激变松弛的胆管排出，然后进入肠道，在肠道的蠕动下最终以排便的形式排出体外。
