双侧多发肾结石并发肾积水首先考虑体外冲击波碎石治疗。要积极治疗肾结石，结石排出后，肾积水一般都会自行消失。小于0.6厘米的结石，口服排石药物治疗，较大的结石可选择体外震波碎石，然后多喝水，多运动，促进结石排出。
右肾结石有少量积水，应采取体外碎石，结石比较大进行手术治疗，疼痛严重，可以使用止痛药物治疗，平时注意休息，不要过度劳累，注意不要吃含钙高的食物，以免容易引起结石复发，要合理的饮食。
肾积水是由肾结石引起的，是否需要摘除需要根据具体情况来判断。
由于肾结石引起的尿液不畅通，引起肾积水，而肾结石伴有严重的肾水肿，则需要进行肾移植；或是肾结石伴慢性严重的炎症，无功能的肾，也要将其摘除；另外，肾结石是一种很大的，是一种鹿角状的结石，它的肾受到了很大的损伤，失去了正常的作用，可以把它摘掉；还有就是肾结石并伴有严重的肾病，例如肾结核、肾癌等，这种肾不能保留，一定要切除。如果是肾结石引起的尿液，排除了结石，排除了堵塞，就可以治疗肾内的淤血，而不需要摘除。
肾结石积水手术方式有两种，一种是经皮肾镜激光碎石，一种是输尿管软镜下激光碎石。采用哪一种手术方式来处理结石主要是根据结石的大小，质地及位置来决定，还有一种治疗方式，不需要住院，在门诊就可以治疗，就是体外震波碎石。
可以采取输尿管肾镜取石或体外冲击波碎石，结石去除后可以采取利尿的方式积极消除积水。肾结石引起的积水，是梗阻导致的尿液无法排出，日久会损伤肾功能，所以排石是首要任务。
