首先是肾盂结石，治疗方法包括体外冲击波碎石、经皮肾镜超声碎石取石术等。其次是输尿管结石，治疗方法有体外冲击波碎石等。最后是膀胱结石，可以行经尿道膀胱结石激光或气压弹道碎石取石手术。
泌尿系统结石如果小于六毫米，可以通过用排石药物治疗。多喝水，每天多蹦蹦跳跳，多爬楼梯，在一个月左右能够排出。大于八毫米的结石不会自动排出。对于一厘米左右的结石，可以做体外冲击波碎石，把结石碎得非常小，然后半个月左右也能慢慢的排出体外。
要快速的将结石排出，平时一定要多饮水，多排尿，每天饮水量在2500毫升以上，还要大量的运动。主要是做一些弹跳的运动，比如跳绳、爬楼梯等。最好能结合一些排石的药物，药物可以缓解输尿管平滑肌的痉挛，促进输尿管的蠕动，促进结石排出。
尿路结石需要尽早的进行排石治疗，尿路结石是不能自愈的，小于一厘米的结石，可以口服药物治疗，注意多喝水，多做跳跃运动，对于大的结石需要考虑体外碎石或者是微创手术。
对于输尿管结石的治疗原则是小于5毫米的不需要特殊治疗，可以自己排出；大于5毫米小于2厘米的可以做体外碎石治疗。大于2厘米的需要手术治疗。患者可以根据超声显示的结石大小进行治疗。同时多喝水，应用消炎药预防感染。
