蕈样肉芽肿的治疗比较麻烦，需要慢慢的调理急不来的。主要的治疗方法是提高免疫力。蕈样肉芽肿属于皮肤疾病，一般无传染性。需要早期诊断早期治疗。如果治疗不及时的话，容易使病情发展成肿瘤，属于恶性肿瘤的一种，存活率很低，尚无明确的治疗方案。平时需要加强防护，避免风寒暑湿的感染，降低抵抗力。所以，蕈样肉芽肿早期是能治愈的。
蕈样肉芽肿又名蕈样霉菌病是起源于记忆性的辅助T细胞的低度恶性的皮肤T细胞淋巴瘤。病程呈慢性渐进性，初期为多种形态的红斑和浸润性损害，以后可发展为肿瘤，晚期可累及淋巴结和内脏，蕈样肉芽肿根据临床可分为表现可分为三期，红斑期又称蕈样。
一般蕈样肉芽肿的治疗要视具体情况而定。要根据病情发展情况和身体状况来确定治疗方法。蕈样肉芽肿有斑片期、斑块期，最严重可发展为肿瘤期。在早期一般局部皮肤治疗即可。
肺部出现炎性的肉芽肿，主要是肺组织出现炎症反应，炎症没有完全的消退，留有不同程度的增生，可以通过药物调理。对于肉芽肿压迫了肺部的气道而引起咳嗽、咳痰、胸闷、气短的时候，可以适当的使用支气管扩张剂。
手术治疗还有中医药治疗，单纯的脓肿的切开治疗，单纯脓肿切开的复发率是非常高的，达到40%左右。所以在手术治疗的时候，要彻底的清除病灶，同时在清除病灶以后，要进行一期的乳腺的整形手术，这样能够达到比较良好的。
局部及全身感染严重者需抗感染治疗，通常1～3周可以控制症状。若继发于特异性感染，应对病原菌予以治疗，如抗结核、抗真菌治疗等。不同的病因选用药物、局部理疗或手术治疗。
