不是所有甲状腺囊肿都需要治疗，而是要根据甲状腺囊肿的大小和形态而定。
一般甲状腺囊肿的诊断主要通过超声，即颈部彩色多普勒明确诊断。微小囊肿如3-4mm囊肿，无需进一步治疗，只需临床观察，无内分泌影响，无压迫局部胀痛的情况下只需每半年或一年进行颈部彩色多普勒，观察囊肿是否变大即可。对于较大囊肿，如给患者带来局部不适及压迫感，则需切除手术。如果确认为良性甲状腺囊肿，可以进行局部切除。而如果确诊为恶性甲状腺囊肿，则需要进行根治性甲状腺切除手术。
甲状腺囊肿最有效的治疗方法是手术切除。如果选用穿刺可以将囊肿中的液体抽出，短期效果很明显，病人也没有什么痛苦，但是囊壁仍然保留，之后还有形成囊肿的可能，所以手术切除是目前对于治疗甲状腺囊肿最可靠有效的方法。
一般情况下，甲状腺结节是甲状腺组织发现实性结节，有可能是单发或多发包括甲状腺囊肿，怎么治好需要根据具体情况进行判断。
如果囊肿或者结节的体积很小，可以观察或者口服一些消炎药进行治疗，一般就可以逐渐消退，如果囊肿或者结节的体积偏大，囊肿生长迅速和囊内出血出现囊肿压迫症状时，到一定程度就需要进行外科手术了。
甲状腺囊肿与甲状腺结节孰重孰轻，就是不做某种评判。
如果经常在早晨起床后感到腰酸背痛的话，那一定要到医院做检查，看一下有没有钙元素不足或其他原因导致骨质疏松，这样才会对症下药，对症治疗。一般甲状腺结节中，有不少属于良性，因此，无论是良性结节还是囊肿，其实对人体并没有太大的影响，因此，病人不必再忧虑。当然，若病人结节恶性，则是甲状腺结节比较严重，并需马上手术。因为甲状腺肿瘤一旦确诊就必须马上施行外科手术治疗。
甲状腺囊肿结节可能没有明显的症状，也可能伴有呼吸困难的症状。
甲状腺囊肿结节一般不会有明显的临床症状。部分病人可能会出现颈部的皮下包块，也可能是因为甲状腺囊肿结节太大，造成气管受压，造成呼吸困难，甚至会压迫食管，造成吞咽困难。甲状腺囊肿结节要做好甲状腺功能、TPO抗体、TG抗体等检查，是否是因为桥本甲状腺炎引起的。
