引起右边头痛的疾病是非常多的，比如脑出血、蛛网膜下腔出血、血管性头痛、紧张性头痛、低颅压头痛等；比如青光眼、鼻窦炎，也会引起头痛；三叉神经痛也会引起头痛，所以不同的头痛，挂的科室是不一样的。
一边头痛多数是偏头痛，引起偏头痛的原因很多，有原发性偏头痛和继发性偏头痛，原发性偏头痛都有家族遗传史，多数是母亲有头痛病史，有个别患者可以有先兆症状，例如在头痛前可以有闪光或暗点等。继发性偏头痛可见动脉粥样硬化，脑部缺血症状引起脑血管性头痛。一边头痛也可以见于头部枕神经痛；也可以见于颞动脉炎引起的头痛。
左侧头痛最常见于脑血管痉挛性头痛、脑血管炎性扩张性疼痛、颅内占位性病变以及精神性头痛。如果在头痛的同时还合并明显的颜面部感染性疾病，则考虑感染性头痛的可能性大，其中以中耳炎、牙痛所诱发的头痛最为多见。
右边头痛可见于侧右侧三叉神经痛，也可见于偏头痛，也可能是由于右侧额窦炎所引起。右侧三叉神经痛的患者可以突然出现头痛，持续时间短暂，多为数秒钟至数分钟不等，可以突然停止，可以反复发作。
头痛的发病机制复杂，主要是因为颅内外痛敏结构中的痛觉感受器，受到剧烈刺激，痛觉由传导通路传导至大脑皮层所引发的。颅内痛敏结构，包括静脉窦，颅底硬脑膜，迷走神经，脑膜前动脉及中动脉，舌咽神经，三叉神经。
