尽管糖类抗原检查在临床上主要作为恶性肿瘤的辅助诊断指标，但糖类抗原水平偏高并不意味着一定得了恶性肿瘤，很多良性疾病也会导致糖类抗原偏高。可以用些相应的药物治疗还要注意饮食。
一般情况下，月经期检查会导致糖类抗原CA125偏高。具体情况分析如下：
女性来例假时出现了子宫内膜剥脱，可能是由于女性在经期出现了应激性CA125升高，因此女性做CA125的时候要注意避免出现在经期。导致CA125升高的主要因素有：子宫内膜异位症、卵巢巧克力囊肿、子宫内膜异位症、卵巢巧克力囊肿等。此外，卵巢癌、肝癌等恶性肿瘤也会增加。CA125升高后需要确定病因和相应的药物。
这可能是肿瘤引起的。糖类抗原主要是一种粘蛋白型的糖类蛋白肿瘤的标志物，是细胞膜上的糖脂质，主要分布于正常胎儿的一些胆囊、肝、肠和正常成年人的一些胆管上皮等处。同时也存在于血液循环的胃肠道肿瘤相关抗原。所以体检的时候，糖类抗原如果是偏高，可由炎症引起，但大多数都是由于肿瘤所引起的。
乙肝表面抗原（HBsAg）的正常值是<0.5ng/ml。大于0.5单位，就是阳性，乙肝表面抗原阳性是感染乙肝的标志。检查中发现乙肝表面抗原阳性，不要就认为得了乙肝，要做进一步的检查才能确诊。平时多注意休息不要熬夜。
糖类抗原CA199是胰腺癌和胆囊胆管癌的标志物。对于胰腺癌或胆管癌或结肠癌在治疗过程中如果出现CA199在原来的基础上有了明显的增高，须详细检查是否出现了肿瘤复发或转移。另一方面胰腺炎、阻塞性黄疸、肝炎、肝硬化、支气管扩张等也会出现CA199的偏高。因此未得过肿瘤，如果出现CA199偏高，也应该做相关的检查排除相关的良、恶性疾病。
糖类抗原为肿瘤标志物的一类，有以下几种，CA125，升高主要见于卵巢癌，其他相关肿瘤在肺癌、胰腺癌、乳腺癌、肝癌、胃肠道恶性肿瘤亦可见到升高，其他因素有：女性盆腔炎、子宫内膜异位、行经期、慢性肝炎、胰腺炎、胆囊炎、肺炎等也会升高。CA199，升高主要见于胰腺癌、胃癌、直肠癌，其他相关肿瘤在肝癌、胆囊癌、胆管癌亦可见到升高。其他因素有很多：消化系统的良性疾病患者中也有升高。