巧克力囊肿手术之后，建议如果是腹腔镜手术，建议在一个半月之后同房，如果是开腹手术，需要是两个月再有性生活。由于巧克力囊肿具有复发性，所以术后要继续给予用药治疗。
3-6个月。做完巧克力囊肿手术之后，子宫和附件还没有完全恢复，要注意休养一段时间。手术后，建议至少三个月在怀孕，让伤口有很好的修复，另外巧囊手术后半年到一年怀孕几率还是比较高的。
术后注意调整自己的情绪，保持乐观开朗的心态，使机体免疫系统的功能正常，手术后注意增加蛋白质的摄入量。蛋白质可以帮助伤口快速好，可以增加体力。选择鱼类，鱼肉比较容易消化和吸收。注意休息，禁食辛辣生冷刺激东西，适当活动，增强身体抵抗力。
做了手术以后要注意休息至少一个星期，要注意保暖，不要受凉了，同时要注意加强营养。手术以后要配合医生服用一些药物来对症治疗。而且，巧克力囊肿手术以后也有可能会复发的可能。所以每年也要注意复查。
卵巢巧克力囊肿手术后是会复发的，复发率也是比较高的。复发的原因主要是因为巧克力囊肿大多数造成囊肿与子宫内壁发生粘连，通过手术也很难将囊肿完全切除，在切除的时候多数会造成囊肿破裂，从而引起复发。
巧克力囊肿手术后可食鸡蛋、鱼类、瘦肉、香菇等。生冷或偏寒性食物尽量少食用：如螃蟹、田螺、甲鱼等。肥厚油腻等肉品尽量少食用。可食用大枣、桂圆等益气养血的水果；多食新鲜蔬菜，黑米，干果类食物；谷类、薯类，豆类等可作为主食。
