胃肠间质瘤是恶性肿瘤，大部分的胃肠间质瘤恶性程度不是很高，治疗方法主要是手术切除及靶向药物治疗。现在诊断是胃肠间质瘤的情况下需要及时的手术切除及病理化验，如果胃肠间质瘤直径大于5厘米的症状下，术后一般需要口服靶向药物如格列卫，预防肿瘤复发及转移。
肠间质瘤是消化道肿瘤中比较常见的软组织肿瘤。其病因多见于KIT以及PDG-FRA的突变。胃肠间质瘤可以起源于胃肠道的任何部位，但是胃及小肠是最为常见的初发部位。病人最常见的症状为进食后饱胀感，腹痛，腹胀，腹腔内出血，消化道出血以及贫血相关性乏力。也可以出现肺以及腹腔淋巴结转移，治疗上以手术为主。
肠间质瘤大多不是早期，因为在早期的时候是很难发现的，一发现的时候都是到了中晚期，应该及时的手术治疗，避免造成严重的危害。聊期间要注意营养健康，不可以喝酒抽烟也不要吃任何辛辣刺激性的食物。
通常情况下，食管间质瘤患者需要做影像学检查、细针穿刺活检等检查。具体情况分析如下：
影像学检查：食管间质瘤是原发于食管内除平滑肌瘤或神经源性肿瘤之外的另一类间叶源性肿瘤，食管间质瘤患者可以通过做CT检查明确肿瘤的部位、大小及侵犯范围，做MRI检查显示肿瘤内坏死、出血、囊性变及周围脏器。
细针穿刺活检：食管间质瘤患者可以通过做细针穿刺活检判断肿块的良恶性。
通常情况下，对于胃间质瘤，如无手术禁忌，则需行外科手术，胃间质瘤则采用腹腔镜下手术，胃底部及胃体部的胃间质瘤则需行胃楔形切除术。切除范围为1~2cm，除肿瘤外，尚有正常胃壁组织。
如果是中高危病人，可以选择伊马替尼作为一种靶向药物。术后要注意饮食，尽量少吃，尽量少吃，尽量少吃东西，术后要定期随访，胃镜检查一年以内。
胃部小间质瘤是否会转移，需要根据性质进行判断。
胃部小间质瘤如属于良性阶段，一般不会出现转移，也不需要进行任何的处理。胃部小间质瘤如属于恶心阶段，癌细胞会顺着淋巴管和血液循环，转移到肝脏、肺部、骨骼，或者是腹内。肿瘤还会侵犯和发展，导致出现食欲减退、恶心呕吐等相关的临床表现；如果向其它地方扩散，还可能会导致肝脏疼痛，胸部疼痛和骨头疼痛。
