肝内胆管结石不会自愈。如果患者有手术指征及早进行手术治疗。采取的手术方式是高位胆管切开取石术。如果患者肝内胆管结石造成某一叶的肝脏萎缩，可以行肝部分切除或者肝段切除。
肝内胆管结石手术费用大概1.5万-2万，不同等级的医院，不同地区收费标准不一样的。疾病严重程度不同，收费也不相同的。生活中注意调养，按时作息，少熬夜，多喝白开水，多吃新鲜的水果和蔬菜，进食营养丰富的饮食，忌食辛辣等刺激性食物。
可以采用无创保肝取石，在ERCP内镜的基础上研制出的一种高新胆管内镜系统，在ERCP内镜基础上，采用十二指肠大乳头球囊扩张胆管出口，将ERCP纤维内镜送入胆总管内，通过胆总管直达肝内胆管，通过肝内胆管球囊扩张肝内胆管，扩开肝内胆管内径，通畅取石通道，可以一次性彻底清除肝内胆管结石，手术全程在视频可视下内镜操作，无痛、无创伤、无出血，一次彻底治愈肝内胆管结石，保住正常的肝脏组织。
肝内胆管结石的花费还需要根据结石的位置、大小、是否引起胆管炎和肝脏萎缩来决定。对于临近第一肝门的肝内胆管结石，可以通过胆总管切开、胆道镜取石的方式进行处理，花费大概需要2万元左右。而对于反复发作胆管炎，引起肝脏萎缩或者癌变的肝内胆管结石，需要进行肝段或肝叶切除术，总体的花费有可能需要3-5万，甚至更高。
年轻人的运动方式可以是跑步、打羽毛球、乒乓球等，老年人则可以走路、慢跑、打太极拳等。肝内胆管结石在进行体育锻炼时要制定合理的计划，量力而行，循序渐进。初始运动量要小，在可承受范围的情况下逐渐增加运动量，达到一定程度即适可而止，一般以不感觉疲劳为准。
可以通过药物刺激，分泌出的胆汁使胆囊口自动打开，胆管自动放大，胆囊收缩时，通过药物刺激变松弛的胆管排出，然后进入肠道，在肠道的蠕动下最终以排便的形式排出体外。
