巴氏腺囊肿可能是由自身消化不良或内分泌治疗引起的，但也可能只是由外部因素的变化引起的。这些囊肿应该通过外科手术切除。手术后，应进行全面检查。放射疗法也可以用于治疗。
巴氏腺囊肿是由于前庭大腺腺管开口阻塞，导致分泌物积聚于腺腔而形成。巴氏腺囊肿小，又没有感染的时候，病人是没有任何自觉症状，通常可以不用进行特殊的处理治疗。而当囊肿增大，病人会出现外阴部的坠胀，以及同房不适等表现，这时候就可以考虑做前庭大腺囊肿的造口手术来进行治疗。
一般情况下，所谓的巴氏腺囊肿，是由于细菌、病毒等特殊病原体感染了外阴，引起了炎症，从而造成了腺管的开口处阻塞，从而造成了腺体的分泌物无法排泄而形成的囊肿。其主要表现为外阴后下1/3部位肿胀，局部肿胀，不能正常走路，会严重影响工作和生活。局部麻醉、前庭大腺囊肿造口术后3-5日即可出院，通常术后1-2周后即可痊愈。
一般情况下，巴氏腺囊肿又称前庭大腺囊肿，通常能好，但是需要积极进行治疗。具体情况分析如下：
称前庭大腺囊肿发生在女性大阴唇与小阴唇的交接部位，因生理或病理因素造成的腺管堵塞，使囊腔内液体无法排泄而形成的囊状肿瘤。对于此症，可以通过外科和药物的方式来进行。可以选择激光造口术，同时要做好清洗、换衣服、防止感染等。若出现脓性感染，应做切口引流术。可以口服一些中药，同时还可以使用大黄牡丹汤、金银花、紫花地丁、丹皮、赤芍等进行消肿止痛的方法。
巴氏腺囊肿（亦称巴多林腺）又称前庭大腺囊肿，前庭大腺位于两侧大阴唇后部，腺体开口于小阴唇内侧近处女膜处。前庭大腺分泌液排出受阻而积聚于管腔，引起腺体囊性扩张，就会引起巴氏腺囊肿。主要症状为一侧阴唇较另一侧肿大，由于巴氏腺囊肿可以长期存在，多年不变，如果不妨碍日常生活，则可以定期观察，无需治疗。
外阴囊肿与巴氏腺囊肿的区别主要就是，一个化脓，而巴氏腺囊肿没有化脓肿它主要是引炎症引起的腺体堵塞。建议到正规医院的妇产科检查，可以进行，口服消炎药物以及坐浴等，治疗。少吃刺激性的食物，多休息。
