临床症状有疼痛和血尿是输尿管结石的主要临床症状。可以出现突发性的腰腹部剧烈疼痛，呈阵发性的绞痛，疼痛非常难忍，可以放射到下腹部或者阴囊、阴唇、大腿内侧等。
当输尿管结石引起急性肾绞痛时，主要表现为患侧腹痛。疼痛的性质是绞痛、隐痛或钝痛，疼痛辐射到腰部、腹股沟、腹部、会阴等部位，出现血尿；多数情况下会伴有腹胀、恶心、呕吐等症状。临床上也有单纯的血尿症状。一些大结石通常不显示肾绞痛。体检是发现肾结石最常用的方法。
出现输尿管的水肿、感染、出血等。如果有不适症状出现后，术后需要抗炎、解痉止痛治疗，并且在术后1-2周左右需要复查彩超，了解结石的粉碎以及排石情况，避免碎石后结石嵌顿在输尿管，引起肾积水的情况出现。
对于输尿管结石上段和下段哪个严重，主要还是看梗阻的时间长短，以及引起肾积水的严重程度来定，有时候上段可能梗阻的时间久了，那就是上段的比较严重。有时候下段的梗阻时间比较久，那就是下段的要更严重。
输尿管结石可以考虑行冲击波体外碎石术，也可以考虑行输尿管镜腔内碎石术，这种微创手术方式来解除泌尿系结石的症状。患有输尿管结石，可能会引起剧烈的腰腹部疼痛以及恶心、呕吐等消化系统症状。
