自然流产第三天了腰疼可能是多种原因导致的，具体分析如下：
如果女性在自然流产后三天会感到腰痛，可能是由于受了某种寒气的刺激，也可能是由于没有休息好，也可能是由于工作过度导致的。在流产后要多休息，不要过度劳累，不要做太多的体力活，要让自己的情绪得到充分的释放。同时要注意保持外阴的卫生，经常更换卫生巾，在一个月之内不能同房。需要到医院做个全面的检查，确定是什么导致了自然流产，然后才能对症治疗。
怀孕以后出现的自然流产一般属于胚胎发育不好的情况，是人类进化自然过程适者生存的表现。自然流产后，阴道出血的时间一般不会超过10天，但是流血量会比正常来一次月经量要多。如果B超检查宫内干净，可不必处理。等下一次来月经之后，可以选择同房。但是同房期间需要采取避孕措施。自然流产以后，不要在第二个月就怀孕，最好是自然流产半年以后才准备怀疑，对女性身体都比较好。
自然流产是指胚胎已经流出来了，这种症状是没有必要再保胎了，少量出血，有可能是先兆流产的表现。如果是先兆流产，查一下甲状腺功能，甲状腺功能如果减低需要服用甲状腺素片，同时服用维生素E和保胎灵等。卧床休息，禁止性生活。
自然流产一般阴道出血的时间不超过一周，如果在自然流产后一周没有阴道出血的症状，说明流干净了。一般在自然流产后一周需要到医院做一个子宫附件B超或彩超检查，看看宫腔内是否有残留物的回声，如果宫腔内没有残留物的回声，说明是流干净了。
自然流产出血会出3到7天左右。但有些女性由于内膜剥落不是特别通畅，所以出血可能会达到十天，通常是不会超过十天以上。而且自然流产的出血量，通常会比正常月经量偏多，不会超过正常月经量的两倍。
