畸胎瘤一旦确诊，必须争取早期手术切除，以避免良性畸胎瘤因耽搁手术而导致肿瘤恶变，同时可预防肿瘤感染、破裂、出血及并发症的发生。畸胎瘤的手术要点是完整地切除肿瘤，卵巢和睾丸肿瘤均做一侧卵巢或睾丸切除，骶尾部畸胎瘤强调务必将尾骨一并切除，以免残留多能细胞而导致肿瘤复发。恶性畸胎瘤如果发展严重，那也会出现转移的，那样也会对生命有影响。
畸胎瘤多数是良性肿瘤，建议做微创手术，创伤性小，恢复也比较快。一般能保留卵巢和子宫的功能，所以治疗后对以后的生育影响不大。但如果是恶性肿瘤，需要做化疗，需要等身体恢复好才能考虑要孩子。
一般情况下，儿童畸胎瘤采取有效措施进行治疗后便不会复发。手术切除、化疗、放疗是儿童畸胎瘤较为常见采取的治疗方法，若是良性的畸胎瘤，一般采取手术切除的方式便可达到较好的治疗效果，后是可以治愈的。但如果肿瘤是位于中线部位，属于恶性，那么仅仅通过手术切除一般不能达到较好的治疗效果，还需根据患者实际情况采取化疗或放疗，但只要谨遵医嘱，保持乐观积极心态，就一般不会复发。
畸胎瘤是良性和恶性的。如果孩子出生时被发现，恶性肿瘤的程度通常更高。可以进一步评估外科治疗是否可行，如果可行，仍然需要外科治疗。特别建议手术结果选择合适的随访治疗方案。邪恶也有可能发生。及时去看医生，以免延误病情。
畸胎瘤是来源于卵巢生殖细胞的肿瘤，大多为良性，但有恶变的可能，较大的畸胎瘤可以发生蒂扭转、破裂和感染引起急腹症。目前没有药物能消除这么大的肿瘤。可靠的治疗方法就是手术。
