甲亢吃赛治的副作用通常有皮疹或皮肤瘙痒及白细胞减少；较少见严重的粒细胞缺乏症；还可能致味觉减退、恶心、呕吐、上腹部不适、关节痛、头晕头痛、脉管炎、红斑狼疮样综合征。可能罕致肝炎、间质性肺炎、肾炎和累及肾脏的血管炎。定期监测血常规、肝肾功能和甲状腺功能等。
甲亢吃赛治一天吃两次在早晚各吃一次就可以。每个人对药物的反应是不一样的，在没有禁忌的情况下，应用赛治疗一般用药后很快就开始起效，但由于甲状腺功能的变化是比较慢的，如果治疗效果比较好，一般在1到3个月临床症状能够明显的改善，甲状腺功能也会相应的变好。
甲亢是甲状腺功能亢进症，转氨酶可能会升高。
甲亢导致肝脏功能受损，或者服用抗甲状腺激素的药物导致肝脏功能异常，都会导致转氨酶升高。患者体内激素水平较高，容易出现心慌、出汗、怕热、食欲亢进等高代谢症候群，体内分解代谢增加，肝脏糖原消耗增加，肝脏负荷增加，谷草转氨酶、谷丙转氨酶等都会升高。另外，甲巯咪唑、丙硫氧啶等抗甲状腺激素生成药物治疗时，可能会引起肝脏损伤，谷草转氨酶等数值升高。若服用甲状腺药物引起的转氨酶升高，可以在医生的建议下进行碘-131治疗和手术治疗。
甲亢病人服用赛治后转为甲减属药物性甲减的正常情况。
由于病人所服赛治属抗甲亢病药，甲亢确诊后，给予口服抗甲状腺药物以控制病人甲状腺激素，当病情逐步痊愈后，病人很可能在不用原所用赛治药物用量时发生药物性甲减。
这时仅需减量赛治服药剂量。若赛治自身服药剂量已较小，且病人服药后甲状腺功能减低仍然存在，血中TRAB亦在正常值内等，则可停药。
赛治的通用名是甲巯咪唑，是最常用的一种治疗甲亢的药物。但是赛治在治疗甲亢过程中有可能会引起肝功能损伤，转氨酶升高。如果转氨酶升高不超过正常值的两倍，可以在加用保肝药的基础上继续使用赛治，但是要密切监测肝功能，如果转氨酶重新下降，就可以接着治疗。