首先会对自身免疫力造成严重损害，会出现嗜睡、出虚汗多、精神萎靡、浑身没有力气。尤其是长期化疗会对膀胱造成损害，造成膀胱炎。还有化疗也会对肝功能造成损害，轻度的可能会出现肝功能不正常的症状，比较严重的还会造成肝脏中毒。化疗还会损害神经系统。
常见的不良反应为胃肠道症状，主要包括腹泻、恶心、呕吐以及黏膜炎；血液系统的不良反应包括中性粒细胞减少、血小板减少；神经系统反应为计量累积性的外周神经感觉病变。
化疗的副作用是，可能会有恶心、呕吐、周身乏力或者厌食、没有食欲，或者会出现肝功能异常、肾功能损伤，还有可能四肢有疱疹出现或者口唇有疱疹出现、皮肤色素沉着，还有的会掉头发。
腹腔热灌注化疗虽然存在一个腹膜的屏障，但是这种方法的毒副作用比较大，而且疗程很长，很难忍耐。该方法可以和肿瘤直接接触，有助于抑制肿瘤的生长发育，但是会带来疼痛感，在治疗的时候要注意温度的把握，如果温度过高，体内的正常组织会受到损伤，也不利于正常细胞的生长，如果温度过低则不能达到治疗效果。
肺心病并非肺癌，无需化疗。
肺心病，即呼吸系统疾病中肺功能障碍性疾病，可能是支气管、肺胸部的原因，肺动脉病变所引起的肺循环阻力升高，右心室增大并伴有或不伴有右心衰竭和其感染的问题。其临床表现为呼吸困难，咳嗽，咳痰，胸痛，胸闷气短和活动后气促，严重者出现心衰，心律失常及休克等症状，甚至危及生命。病人若被诊断为肺心病，由于肺心病并非肺癌，无需化疗。目前西医对于本病尚无特效疗法，只能对症支持及抗感染治疗。中医治疗本病采用肃肺化痰、降气贫血、活血化瘀、益气补肺等方法，温补脾肾等治之。
化疗产生的副作用可能最常见的是消化道反应，有恶心、呕吐、反酸等症状，处理方法主要是应用止吐的药，比如昂丹司琼、甲氧氯普胺，还有抑制胃酸的药，比如质子泵抑制剂之类的，还有西咪替丁，都可以改善胃肠道反应。
