一些患者肝脏功能检查不会发现乙肝，有的患者肝脏功能没有异常，有的患者会出现肝功能不全，但不一定是病因。乙肝分为两大类，即传染性肝炎和不传染性肝炎。两种类型的肝细胞都会导致肝脏的不正常。需要做一些HBV、HCV、肝彩超等的检查来确诊。
乙肝五项检查又称乙肝两对半，乙肝五项指标是乙肝病毒（HBV）感染的重要标志，其指标通常指乙型肝炎病毒表面抗原（HBsAg）、乙型肝炎表面抗体（抗-HBs）、乙型肝炎e抗原（HBeAg）、乙型肝炎e抗体（抗-HBe）、乙型肝炎核心抗体（抗-HBc）。
肝功能不能查出乙肝，是两个不同的抽血化验项目，乙肝病毒的检查，是通过乙肝五项，或者是乙肝病毒DNA定量来进行的。只有在乙肝病毒导致肝损害的时候，才会出现肝功能的异常。
检查肝功能并不能够明确是否存在乙肝。肝功能检查以后会出现转氨酶、胆红素等相关指标的升高或者异常，由于临床上引起指标异常的原因很多，单凭肝功能检查还不能够确定具体的疾病，乙肝的诊断主要是通过乙肝五项。
肝功能主要有转氨酶类，升高异常代表肝脏有炎症如肝炎病毒感染、酒精性肝炎、肝硬化、肝肿瘤、脂肪肝等初步了解，肝功能中胆红素类异常有可能会有肝胆问题，如果胆结石、胰头癌、胆囊炎、肝炎等的初步了解，肝功能的白球蛋白系列可以观察免疫反应情况。
肝硬化出现肝腹水，说明肝硬化失代偿期，是肝病晚期，合并肝功能衰竭，绝对多数是由于慢性肝病演变而来的，目前可以保守治疗和肝移植治疗，保守治疗费用低、但效果相对要差；肝移植效果要好，但费用高，目前维持时间还不是很长。
查肝功能是不能检查出肝炎的。肝功能检查是与肝脏功能代谢有关的指标，主要反应肝脏功能的基本情况，而肝炎属于肝脏疾病，通过肝功能检查可以检查出肝脏疾病，但无法判断是否感染乙肝病毒，所以不能检查出肝炎。
