输卵管堵塞的病因有许多。除了先天性发育畸形导致不通外，还有妇科炎症盆腔渗出物长期刺激，相邻组织器官的病变等。妇科炎症感染，人工流产，长期阴道出血，不洁的性生活，如输卵管子宫内膜移位症、腹腔手术、阑尾炎手术、取放节育环、盆腔结核等，均可引起输卵管感染，而导致输卵管管壁充血、水肿、粘连而堵塞。
输卵管堵塞的常见病因，除了先天性发育畸形导致不通外，还有妇科炎症盆腔渗出物长期刺激，妇科炎症感染，人工流产，长期阴道出血，不洁的性生活等都会造成输卵管堵塞的，所以要赶紧治疗。
输卵管堵塞最常见的原因是因为输卵管的慢性炎症引起。盆腔炎症未能得到及时正确的诊断治疗，就可能会发生盆腔炎性疾病后遗症，以往称为慢性盆腔炎。慢性炎症的长期刺激，主要引起的病理改变为组织破坏，广泛粘连，增生及瘢痕形成，就可能会导致输卵管增粗，输卵管阻塞。输卵管如果发生子宫内膜异位症，可能会导致输卵管的阻塞。输卵管的妊娠史或者是手术史可能会造成输卵管的阻塞。
大多数输卵管疾病继发于感染，尤其是盆腔炎症性疾病（PID）。感染的其他可能原因包括阑尾穿孔、流产后感染或手术后并发症，如子宫内膜异位症和外科手术造成的炎症状态，由于粘连可导致输卵管的闭塞。
当发生输卵管炎时，输卵管的最狭窄部分及伞端很容易发生粘连而造成管腔狭窄或完全闭锁，这样，精子和卵子就不能在管腔内相遇，因而造成不孕。慢性盆腔炎多表现为双侧输卵管炎，久而久之使输卵管的开口，特别是接受卵子的那一端(称之为伞端)部分或全部闭锁，也可使输卵管内层粘膜因炎症粘连，使管腔变窄或闭锁，精卵的通行发生障碍，导致不孕。
输卵管阻塞和痛经、带下、症瘕、不孕等有关，多是淤血阻滞，胞络不通。肾气虚弱，血脉不利：肝气郁结，气滞血淤；湿热蕴结；淤血阻滞；寒凝血淤；胞脉阻滞，则输卵管阻塞不通；情志抑郁，肝气郁结，气滞血淤，淤血阻滞，胞络不通，则输卵管阻塞不通。
