肛瘘的症状是会排脓，脓汁粘稠，黄色、味臭；瘘管日久的排脓相对较少，或时有时无，稀淡如水；若脓量增加，则表示新瘘管生成瘘管有时会暂时封闭，不排脓液，从而出现局部肿痛，体温上升。
肛瘘的临床表现是外口反复流出少量的脓性分泌物或者粪水，分泌物时多时少，由于分泌的刺激可引起肛周皮肤瘙痒，有时还有气体从外口溢出。如果外口关闭，由于引流不畅可再次出现肛周脓肿的表现，如局部的红肿热痛，严重者可出现发热，乏力等全身中毒症状。
肛瘘常见的病因包括腹泻，上火，免疫力低下，比如本身有糖尿病等。最终导致肛门内部肛窦发炎，引起的肛瘘通常是需要手术治疗，或者内痔注射过深或手术后感染，产后会阴缝合后感染，前列腺、尿道手术后感染等，均可波及肛门直肠引起脓肿及瘘。
肛瘘多是非特异性感染的，少数为结核性的。要去当地正规专业医院检查病因后治疗。肛瘘是肛门直肠瘘的简称，是发生在肛门直肠周围的脓肿溃破或切口引流的后遗病变。肛瘘是脓肿后时代，是一个疾病的两个阶段。英文名Analfistula，中医称为肛漏。
肛瘘多数由直肠肛管周围脓肿引起，肛瘘是脓肿的后期，病人前期肛门处点疼痛没注意，脓肿破溃后，没有进一步治疗，感染就会像肛管的方向发展，形成肛瘘。肛瘘的病人一般用消炎药，外用药很难好，如果肛瘘要尽快到医院做择期手术治疗。