接种乙脑疫苗几乎没有什么副反应，个别的孩子会出现两天以内的轻微的发热的症状，均在38℃以下。此外七岁以上的孩子儿童如果是需要加强接种的时候，接种的部位可能会出现红肿，偶尔也有血管性的水肿和过敏性的休克，发生在注射后的10-30分钟。
局部的红肿疼痛，以及肌肉不时跳动是疫苗常见的不良反应，这种不良反应都视为轻微的副作用，不做处理大多数都可自行消退，注意别用热水刺激或浸泡，易出现感染，如果有红肿，可适当用冰块做下冷敷。
接种B型流感嗜血杆菌疫苗的不良反应有容易引起针眼处红肿、疼痛，还容易引起发烧、恶心、呕吐、拉肚子的现象。注射疫苗后，要注意局部卫生，如果局部红肿，可能有感染引起的。
乙脑减毒活疫苗不良反应发生率比较低。主要表现为局部反应和全身症状。接种部位在上臂外侧三角肌下缘，皮下注射，可以引起该部位局部红肿，硬结，疼痛，一般症状较轻，用温毛巾局部热敷后1-2天，可以消失。全身反应可以表现为发热，一般为中、低度发热，精神状态良好，若体温大于38.5度，可以给予退热药对症治疗，一般无需特殊处理，在1-2天后自行恢复正常。
新生儿接种第二针乙肝疫苗可能在接种后24小时左右，接种部位会出现硬块发痒，红肿等症状，也有可能伴有不同程度的发热，恶心，食欲不振，腹痛，腹泻等。若持续高烧不退，应及时到医院就诊。
这种药物有解热镇痛，利咽解毒，祛痰定惊，咽喉肿痛以及肺热痰多所引起的咳嗽。用药之前，需要把孩子的大便排干净，以免退热栓的塞入会导致孩子排便的现象，影响药物的使用效果。
