通常对于囊肿的治疗来说，首先要彻底分清区分囊肿是属于良性还是恶性的。如果囊肿是良性的，没有必要担心了，可以通过口服一些中药进行保守治疗慢慢调养。但如果囊肿是恶性的话建议要尽早采用手术的治疗方式进行治疗，如果手术治疗方式效果不佳的话，还可以再生全身化疗的方式，这些方法就可以彻底治疗囊肿。如肾脏囊肿，若是4cm以上的肾脏囊肿，可以通过腹腔镜手术就可以治疗；4cm以下的肾脏囊肿，也可以通过B超定位下穿刺进行治疗。
卵巢囊肿手术治疗的方法，由自身综合情况来选择的。如果，年龄比较大，没有生育要求了，可以选择同时切除卵巢，这是指卵巢上是良性的肿瘤，如果卵巢上的肿瘤是恶性的，那就是必须要切除卵巢了。
皮样囊肿不切除可能会导致局部出现化脓性感染。
皮样囊肿临床种类较多，如不及早切除治疗，可发生某些化脓性感染，并且对患者外观情况有很大的影响，不同程度地增加了患者心理压力。所以对于这种病要及时进行诊断并做好预防工作。提示患者发现后，宜立即手术切除处理，那么手术后就必须多在家里休息了，食用绿叶蔬菜、水果，促进疾病康复。
卵巢囊肿的大小，可以通过自己躺在床上，平躺着然后按压小肚子两侧卵巢的位置，看看是否能够摸到肿块，这也是检查的办法之一，不过这种检查不是很准确。检查方式还是通过B超检查，能够测出囊肿的大小，也能预估生长的速度，判断也更为准确。
可以在门诊手术室就可以进行的。跟一般软组织手术愈合时间一样，一般伤口愈合要两个星期左右，其间一般要注意切口卫生，因为是无菌手术，一般不需要抗生素预防感染，预防肌腱粘连，3到4周一般恢复正常。
