如果是单纯的甲状腺点状钙化，通常多为良性病变，并不严重。
但是点状钙化同时伴有甲状腺结节时，应考虑结节的良恶性。实质性低回声结节，伴微钙化，或结节纵横比大于1，结节边缘不规则，颈部淋巴结肿胀等表现，提示恶性可能性大，再行细针穿刺检查。超声引导下细针穿刺检查，目前仍是鉴别甲状腺肿瘤良恶性的金标准。恶性疑似，细针穿刺疑似恶性，确定恶性结节需治疗手术。结节有压迫症状也需治疗手术，有良性结节也需定期随访。
前列腺钙化一般是慢性炎症的后果，或者前列腺很多腺管引流不通畅，滞留形成的钙化是没有什么危害的，但是有的钙化如果是结石引起的，就需要进一步检查，以免影响前列腺功能。
乳腺钙化的治疗，要根据钙化的情况而定。粗大钙化灶为乳腺的良性病变，无需特殊处理，只要注意定期的随诊、复查便可以。多个细小的钙化灶聚集成簇，需要手术进行切除，行病理检测。
可以先试试药物治疗，常用的有止痛剂、镇静剂、维生素（如B1、B12）、血管扩张剂，也可以用中药止痛膏药外敷配合治疗，如果药物治疗效果不佳，还是选择牵引治疗、推拿、理疗等方法治疗。
宝宝牙齿钙化可通过日常护理、换药等挽救。
如果是因为不经常刷牙，那么就会出现蛀牙的症状，平时要定期给孩子刷牙，尽量减少糖的摄入，通常是为了延缓其腐坏的速度，可以对孩子进行牙齿的封闭，这样也可以在一定的范围内找到恒牙，只要保持不痛，以后再进行更换。
在换牙后，仍需注意做好牙齿清洁护理，避免过度吃甜食，才有助于较好地维护牙齿健康。
